Прямо перед завершением Войны клонов Бракованная партия получает Приказ 66. Но последуют ли ему все солдаты? Вернувшись на Камино, герои обнаруживают, что власть сменилась, а также знакомятся с молодым дефективным клоном. Вскоре адмирал Таркин появляется с новым заданием, которое должно определить, на чьей стороне теперь будут сражаться герои.
Бракованная партия и Омега отправляются на встречу с беглым клоном, который успел обзавестись семьей и мечтает о переезде в более безопасное место. Чтобы это сделать, дезертиру нужны особые коды шифрования, которые он не может получить без риска быть замеченным властями. Смогут ли Охотник и его ребята помочь герою?
Бракованная партия и Омега оказываются на пустынной луне после того, как их корабль потерпел крушение, а местное чудовище похитило важнейшую его деталь. Смогут ли герои заполучить устройство назад? В это время на Камино адмирал Таркин и Крушила готовят новый отряд солдат и поручают командование Прицельщику.
По пути на планету, где они планируют укрыться, Бракованная партия вынуждена заглянуть на соседнюю планету, чтобы пополнить запасы и попытаться скрыть свой корабль с радаров Империи. Их появление не проходит незамеченным. Удастся ли героям снова уйти от преследования и сохранить жизнь маленькой Омеги?
В надежде выяснить, кто нанял Шэнд для похищения Омеги, Бракованная партия отправляется к знакомому джедаю Эхо, у которой может быть нужная информация. Однако помощь не бывает бесплатной, и прежде героям придется спасти другого ребенка. Смогут ли Охотник и команда выполнить задание и найти свою подопечную?
Сид поручает Бракованной партии похитить с Кореллиана тактического дроида, на котором может храниться важная информация. Отправившись на задание, клоны вскоре узнают, что не только Сид хочет заполучить разведданные. Операция оказывается под угрозой, когда Крушила получает серьезное ранение, а на след героев выходит полиция.
После провала операции по возвращению тактического дроида Сид поручает Бракованной партии новое, еще более сложное задание. Однако прежде герои должны помочь старому знакомому Трэйс и Рафы. Эта встреча может привести к большим переменам в их жизни. Смогут ли клоны стать полностью свободными от Империи?
Когда недоброжелатели доносят Империи о местоположении Бракованной партии, командование поручает Прицельщику поймать беглых клонов. Герои оказываются загнаны в угол на собственном корабле и ищут разные способы избежать поимки. В это время Лама Су начинает переживать за судьбу Омеги и принимает новое решение.
Члены Бракованной партии узнают, что Омега — единственный выживший не модифицированный клон Джанго Фетта, что делает ее очень ценной добычей. Пока команда пытается догнать Бэйна, Омега сама ищет способы вырваться на свободу и подать сигнал друзьям. Лама Су отдает подчиненным приказы, которые могут решить исход этого приключения.
На планете, во время войны служившей штабом сепаратистов, Империя вводит новые законы и назначает нового сенатора. Однако его вступление в должность идет не по плану... Когда Сид соглашается помочь опальному политику, она обращается к Бракованной партии. Смогут ли герои помочь старой подруге и при этом не ухудшить свое положение?
Когда сенатор Орн Фри Таа объявляет о создании имперского предприятия на его планете и призывает повстанцев сложить оружие, лидер сопротивления Чам Синдулла публично выражает свою поддержку Империи. Но что на самом деле задумал разбойник? Когда Гоби Гли и дочь Чама, Гера, отправляются за новой партией оружия, на их пути возникает неожиданное препятствие.
Когда родители Геры оказываются в тюрьме, героиня обращается к Омеге с просьбой спасти их. Согласится ли Бракованная партия принять в этом участие? Операция может оказаться непростой, однако беглые клоны могут встретить неожиданного сторонника. Рампарт начинает осознавать опасность героев и отдает последний приказ.
Когда Бракованная партия возвращается с очередного задания, герои обнаруживают, что Сид оказалась на улице, а ее убежище захвачено криминальным боссом. У Сид есть план, как проникнуть внутрь и вернуть себе ценную вещь, но удастся ли героям воплотить эту идею в жизнь? Приключение может оказаться опасным и с непредсказуемым концом.
К Бракованной партии обращается за помощью старый знакомый, который получил сигнал тревоги от еще одного клона. Отправившись на планету-источник сигнала, команда героев обнаруживает имперскую базу, где обычных людей тренируют на замену армии клонов. Удастся героям спасти нужного им человека и при этом не потерять друг друга?
Охотник оказывается в ловушке, а Прицельщик собирается заманить в нее и остальных членов команды. В это время Омега показывает друзьям секретную лабораторию, где их ждет новый знакомый. Бракованная партия предпринимает попытку спасти Охотника и уговорить Прицельщика избавиться от чипа, но согласиться ли он на это?
Когда обломки города начинают тонуть в океане, Рампарт и силы Империи сбегают с планеты, в то время как Бракованная партия должна сама найти выход на поверхность, чтобы выжить. Омега и Прицельщик оказываются в западне в одной комнате — смогут ли они найти способ добраться до своего корабля? Возможно, для этого придется снова рискнуть жизнью...
Благодаря информации от Фи Гения Сид решает отправить Бракованную партию за сундуком, принадлежащим Дуку. Команда отправляется на планету, но в процессе ограбления их обнаруживают силы Империи. Омега и другие оказываются запертыми на грузовом корабле.
Ромар Аделл становится новым знакомым участников Бракованной партии, от которого они узнают о свободной жизни. Омега спешит за наживой, что приводит к очередной встрече с силами Империи. Вице-адмирал Рампарт решает не сообщать Адмиралу Тракину о том, что Отряд 99 еще жив.
Командир Коди отправляется на сепаратистскую планету, чтобы спасти губернатора Гроттона, оказавшегося в заложниках. Тони Эймс отказывается подчиняться Империи, и, несмотря на попытки Коди решить вопрос мирным путем, планета насильно переходит под имперский контроль.
Охотник и Эхо уезжают на задание, пока Сид вместе с Омегой, Техом и Крушилой отправляются на гонку, чтобы увидеться с лихим Тэй-О. Грини Миллеги вызывает Сид на состязание. Обманным путем гонщику Миллеги удается победить, но клоны бросают ему вызов на еще одну гонку.
Омега и Крушила роются на свалке и находят древнюю реликвию, которая указывает на местонахождение сокровищ. Уговорив Бракованную партию отправиться на поиски, герои находят камень, который неожиданно пробуждает буйного робота. Группе нужно остановить его, пока он не разрушил все вокруг.
При участии Омеги молодой джедай-вуки сбегает от недоброжелателей, и Бракованная партия решает помочь ему вернуться домой. Вскоре они узнают, что планета Кашиик страдает от трандошанских наемников и вместе с местными жителями начинают борьбу с вражескими представителями Империи.
Вице-адмирал Рампарт продвигает новый закон, по которому будет разрешено брать в армию граждан Империи. К Сенатору, представляющему интересы клонов, обращается Клон-солдат из-за убийства друга. Он начинает расследование заговора Рампарта, но оно может стоить ему жизни.
По просьбе Рекса и сенатора Чучи Бракованная партия подключается к ним, чтобы противостоять заговору Вице-адмирала Рампарта. Команда разделяется: Омега отправляется с Чучи на встречу с другими сенаторами, пока остальные пытаются украсть копию журнала Рампарта.
Сид отправляет Бракованную партию за минералом в шахту, и во время поисков их корабль угоняют. По пути к космопорту герои оказываются в ловушке, и вскоре Омега и Тех отделяются от всех остальных. Смогут ли они найти выход из шахты и предупредить Сид о том, что произошло?
Юный вор по имени Бэнни Баро отвозит корабль к Мокко, который собирается разобрать его на части. Омега пытается определить местоположение «Мародера», и Бракованная партия отправляется к Мокко. Бенни приводит их в нужное место, однако вскоре действует в своих интересах, и его хозяин узнает о неожиданных гостях.
Лейтенант Нолан отправляет на задание Прицельщика и Мэйдэя, но природное явление меняет их планы. Прицельщик пытается спасти жизнь своего товарища, но для Нолана потерянный груз оказывается важнее всего. Разозленный отношением лейтенанта, Прицельщик не может сдержать своего гнева.
Бракованная партия решает не иметь ничего общего с Сид и вместе с Омегой отправляется на остров по просьбе Фи Генуи. Природное бедствие угрожает части города, и Охотнику предстоит спасти Лиану и Омегу, в то время как остальная часть команды будет помогать эвакуировать местных жителей.
Участники Бракованной партии спасают из заточения нескольких клонов, которых обвиняли в неповиновении Империи. На Корусанте сенатор Чучи расспрашивает бывших заключенных о том, что могло с ними случиться. Тем временем Хемлок выясняет у Прицельщика, где находится Бракованная партия — особенно его интересует Омега.
Бракованная партия отправляется вслед за доктором Хемлоком и пробирается на базу, где проходит встреча по поводу секретных исследований. Неожиданно они сталкиваются с Со Геррерой, прибывшим туда со своей целью. Вместе им не удается скрыть свое присутствие, и у клонов появляется большая проблема с возвращением обратно.
Тех готов пожертвовать собой ради команды, и Бракованная партия возвращается без него. Из-за предательства Сид доктор Хемлок захватывает Охотника и Крушилу, что заставляет Омегу выйти из укрытия. Эхо и Ази спешат на помощь друзьям, но Омега оказывается в плену, где ее ждет неожиданная встреча.