Как только юный гений Тони Старк заканчивает разработку бронированного костюма Железного Человека, весь его мир рушится. Его отец убит, его дом далеко, и всё в его жизни круто изменилось. В поисках истины, Тони примеряет броню, используя помощь своих друзей Роди и Пеппер.
Тони чувствует, что Обадайа Стэйн, новый глава Старк Интэрнэшнл, причастен к смерти его отца. Подозрения Тони усиливаются, когда он узнаёт, что Стэйн превращает изобретения его отца, известные как Земляные Буры, в мощное оружие. При расследовании этой ситуации, Железный Человек вынужден противостоять мистическому персонажу по имени Мандарин.
После того, как Тони захвачен секретной организацией, он узнаёт, что отчим Джина имеет к этому некоторое отношение.
Несмотря на предостережения Роди, Тони вступает в союз с человеком, называющим себя Буран. Желая разобраться с Обадайей Стэйном, Тони чувствует, что новое товарищество будет ему выгодно. Но тот ли человек Буран, за которого он себя выдаёт?
Пеппер и её отца преследует производитель оружия Мистер Фикс. Тони должен спасти ситуацию, и в то же время не раскрыть секрет Железного Человека. Однако, эта задача становится почти невыполнимой, когда Мистер Фикс вводит в действие своего агента по имени Хлыст.
Иван Ванко, учёный, который был брошен в космосе два года назад, аварийно приземлился в Нью-Йорке. Выживший благодаря защитному костюму с названием "Красный Динамо", Ванко жаждет отомстить людям, которые послали его в космос и бросили там - секретному проекту Пегас. Ещё одна миссия Железного Человека - остановить Красного Динамо и не дать ему разрушить проект Пегас.
Дилемма между нормальной подростковой жизнью и Железным Человеком становится слишком обременительной для Тони. Решив, что школа ему больше не нужна, Тони хочет посвятить всё своё время спасению мира в облике Железного Человека. Но когда появляется новый злодей по имени Живой Лазер, Тони узнаёт, что по завещанию отца он обязан получить образование, чтобы стать владельцем Старк Интэрнэшнл
Тони пробирается в Старк Интэрнэшнл с помощью своей новой Невидимой Брони. К несчастью, у брони заканчивается заряд энергии, и Тони вынужден оставить её в Старк Интэрнэшнл . Когда Тони выгоняют из здания, Роди и Пеппер должны помочь вернуть броню прежде, чем тайна Железного Человека будет раскрыта.
Поиск древних Маклуанских Колец для Тони и его друзей оборачивается опасным приключением, когда вдруг в подземном древнем Храме оживают стражи Колец, Грозные рыцари.
Во время школьной ярмарки вакансий к Тони втирается в доверие один из лидеров организации А.И.М. (Адаптивные Идеи в Механике). Предлагая свою помощь, Тони тем же самым обретает нового врага по имени Контроллер. Под управление Контроллера попадают друзья Тони, но Железный Человек должен со всем справиться и спасти ситуацию.
Когда вдруг Обадайа Стэйн начинает себя вести странно и неестественно, Тони желает в этом разобраться. Оказалось, что это Мадам Маска, злодейка, меняющая свой внешний вид, изображала из себя Обадайу. И она имеет новую цель: Железный Человек. Теперь Тони должен очистить имя Железного Человека после того, как полиция объявляет его в розыск за преступления, совершённые Мадам Маской в его обличье.
Проект "Пегас" под управлением Обадайи Стэйна создаёт модернизированную версию Красного Динамо. При помощи Динамо они захватывают Железного Человека и начинают исследование его брони. После того, как Роди и Пеппер вызволяют Железного Человека, Тони жаждет мести. На этот раз Железный Человек побеждает Красного Динамо при помощи своего нового костюма - Брони Разрушителя.
Когда Тони и Джин находят третье маклуанское кольцо, они спорят как именно нужно поступить с ним и новым испытанием. Взяв инициативу в свои руки, Джин неожиданно освобождает хранителя кольца, Робота. Железный Человек пытается задержать Робота, но вынужден ещё и бороться с возвратившимся Мандарином.
Мистер Фикс снабжает Хлыста новым оружием, которое поражает костюм Железного Человека. Сочетание этого поражения с обновлением системы брони приводит к её неуправляемости. Когда Броня начала действовать самостоятельно, Тони оказался заперт внутри неё. Не найдя способа выбраться, Тони боится, что он навсегда будет закован внутри Железного Человека.
Идя по следу Мозеса Магнума к тайной штаб-квартире А.И.М., Железный Человек встречается с Чёрной Пантерой, который тоже охотится на Магнума. Надеясь на объединение усилий, Железный Человек предлагает Чёрной Пантере помощь. К сожалению, Пантера охотится лишь на Магнума и угрожает раскрыть секрет Железного Человека, если тот встанет на его пути.
Железный Человек встаёт на защиту Земли, когда Живой Лазер угрожает ей с космического телескопа. Однако, вскоре Ник Фьюри и Щ.И.Т. связываются с Тони и требуют не мешать. Не зная, кому доверять, Тони стоит перед выбором, решать ли задачу самому.
Наёмный убийца Призрак преследует Тони Старка. Мадам Маска украдкой пытается защитить его. Опасаясь, что его друзья тоже могут пострадать, Тони старается уберечь их от беды. Но Призрак похищает Уитни Стэйн, и Тони вынужден обратиться к своим друзьям за помощью.
Благодаря своему любопытству, Пэппер очутилась в самом эпицентре столкновения между преступными кланами Тонг и Маджия. Юный Мандарин, чтобы не раскрыть себя и спасти Пэппер, вынужден обратиться за помощью к единственному, кто может в этой ситуации помочь - Железному Человеку. Но ниндзя из клана Тонг уже почуяли подвох...
Тони, создав зловещий вирус под названием Технопожиратель, уверен, что всё в порядке и беспокоиться не о чем. Однако, вирус растёт и становится угрозой для Железного Человека.
Ведётся поиск четвёртого Маклуанского Кольца. Джин вспоминает свою мать и данное ему с рождения право на трон Мандарина. Огненный Хранитель Кольца удерживает Пэппер и Роуди внутри активного вулкана, готового взорваться в любую минуту, а Железный Человек пытается освободить от него своих друзей.
А.И.М. использует умирающего Живого Лазера для запуска новейшего создания - разумного организма, созданного для завоевания М.О.Д.О.К. Железный Человек не может побороть мозговые атаки М.О.Д.О.К.а. и это побуждает Живого Лазера помочь Тони и спасти ему жизнь.
После того, как Тони позволил Роуди надеть костюм Железного Человека, чтобы попробовать полетать в нём, костюм попадает в руки Хэппи Хогана. Теперь, Тони должен помочь Хогану нарушить планы Маджии, в то же время не раскрывая своего секрета.
Контроллер использует мальчика по имени Рик Джонс, чтобы заставить Халка отомстить А.И.М. Вмешавшись в происходящее, Железный Человек сам попадает под управление Контроллера и только Халк сможет остановить злодея.
Обадайя Стэйн призывает на помощь Тони, чтобы тот помог вылечить его дочь Уитни. Зная о том, что необходимый для создания лекарства элемент находится в заброшенном арктическом лагере Старк Интернэшнл, Железный Человек направляется туда. Не в силах сидеть на месте и ждать, Стэйн заставляет Бурана также отправиться за полярный круг.
Шенг, отчим Джина Хана и бывший Мандарин, берёт в плен Тони и его друзей, чтобы получить все пять маклуанских колец. Пробудившийся хранитель пятого кольца, могучий дракон Фин Фэнг Фум становится для друзей серьёзной проблемой. Смогут ли Тони и Джин справиться без помощи костюма Железного Человека или остальных маклуанских колец?
Облачённый в костюм Боевой Машины, Роуди прибывает как раз вовремя, чтобы спасти своих друзей от хранителя пятого кольца, дракона Фин Фэнг Фум. Теперь эта схватка становится ещё более эпической, Железный Человек и Боевая Машина меряются силами с драконом и Мандарином.
После многомесячного перерыва Тони снова вынужден стать Непобедимым Железным Человеком, когда тайный босс Мистера Фикса заказывает похищение Джастина Хаммера и Обадайи Стэйна.
В тот момент, когда Тони ранен, а компании его отца грозит опасность, Железный Человек вынужден надеть свою новую Броню Номер Два и плечом к плечу с Боевой Машиной драться с объединёнными силами Бурана, Хлыста и Мистера Фикса, нанятых загадочным боссом.
В попытке заново материализовать Живого Лазера, Мистер Фикс разделяет его надвое - одна половина ищет помощи у Железного Человека, а другая угрожает всей Земле.
Обадайя Стэйн нанимает Призрака, чтобы тот помог ему заполучить броню Железного Человека.
Обадайя Стэйн использует украденные у Тони чертежи для массового производства супергеройских костюмов. Железному Человеку остаётся только одно - дискредитировать детища Стэйна в глазах жителей города.
Расследуя серию атак на Хаммер Мультинэшнл, Тони выясняет, что Старк Интэрнэшнл причастен к гражданской войне.
Новое детище Хаммера сильно повреждает Боевую Машину, а броню Железного Человека разрушает.
Доктор Дум приезжает в Нью-Йорк, чтобы забрать украденные чертежи Железного Человека. Тони должен во что бы то ни стало помешать ему.
Железный Человек пытается остановить Соколиного Глаза и Чёрную Вдову, когда те крадут чип интерфейса из Старк Интэрнэшнл. Ситуация усложняется, когда чип попадает в руки Титанового Человека.
Стэйн завершает создание Железного Дельца, так что Тони и Роуди приходится биться с ним не на жизнь, а на смерть.
Ник Фьюри обращается за помощью к Железному Человеку после похищения с вертоносца Щ.И.Т.а секретных данных, но коварная Чёрная Вдова подставляет Железного Человека и тем самым делает его врагом Ника Фьюри и его организации.
Завистливая Рона превращает Академию Будущего в смертельный лабиринт ловушек для Тони и его одноклассников, в то время как её брат-близнец Энди оказывается также в смертельной опасности.
После увольнения Стейна из Старк Интернешнл, он узнает, кем является Железный человек. Обадия крадет броню Iron Monger, чтобы уничтожить Тони Старка раз и навсегда. Это будет великая битва, которая включает себя и коварного Человека-Титаниума (Titanium Man).
Мандарин возвратился и ему нужна помощь Тони для поиска 8-го кольца. Тони отказывается, но когда Мандарин пообещал рассказать правду об отце Старка, они объединяют силы.
Когда Хаммер выкупает Stark International, оставшийся без гроша Тони клянется, что не пред чем не остановиться, пока мир не узнает, каким Хаммер является на самом деле – злым гением преступного мира!
Когда Агента Маллена уволили из Щ.И.Та, он принимает супер-сыворотку “Extremis” и мутирует в сильного маньяка, жаждущего мести. Сможет ли Железный Человек остановит такого мощного противника?
Анна, новая подруга Тони, оказывается бежавшим от Магнето мутантом . Железный Человек пытается защитить её, но как же ему сражаться с властителем металла?
В будущем, внук Тони Старка Андрос(Andros) - Железный Человек 2099. Кроме своего путешествия во времени супер-броня не предназначена для спасения, вместо этого она может уничтожить Тони Старка!
Контроллер, жаждущий мести, разработал тщательно продуманный план массового подчинения города с помощью новой виртуальной технологии "Центральный процессор". Тони в конце концов понимает, что находится в виртуальном городе Контроллера, который безнадежно обезумел после их последней встречи. Он хочет, чтобы каждый стал частью "Центрального процессора". Железный Человек разрушает виртуальный город байт за байтом, перенося себя в реальный мир, где он сражается с Контроллером как человек с человеком.
Железный Человек объединяется со своим врагом Мандарином, чтобы остановить Доктора Дума, прежде чем тот захватит девятое кольцо и отца Тони.
Стараясь защитить свою компанию от Старков, становящийся всё более и более безумным Джастин Хаммер натравливает Титанового Человека на своих бывших пособников и разрабатывает зловещий зомби-газ.
Сбежавший ученый Брюс Бэннер разыскивает Старка, чтобы просить о помощи. Во время атаки беглеца армией Щ.И.Т.а Железный Человек сражается с ними и защищает Халка, а затем укрощает его гнев.
Тони и его отец Говард пришли навестить Обадайю Стэйна в больницу и обнаружили, что бывший магнат исчез. Тони отчаянно пытается найти его, но прежде начинают происходить весьма странные события. Роуди и Пэппер стараются убедить Уитни оказать им помощь в поисках её отца, но всё это уже будет напрасно.
Пэппер становится новым героем в броне - Спасительницей, и присоединяется к Железному Человеку и Боевой Машине, чтобы выследить Мандарина в Китае, где чужеземный Маклуанский Хранитель раскрывает шокирующую правду о кольцах!
Обладая всеми десятью кольцами, Мандарин собирается править миром, но вместо этого он случайно подаёт сигнал чужеземному флоту Маклуанского Повелителя атаковать планету Земля! Смогут ли Железный Человек, Боевая Машина, Спасительница, Джин и Щ.И.Т. остановить эту новую угрозу?
С помощью Джина на борту маклуанского корабля и Говарда Старка в оружейной, Железный Человек, Боевая Машина и Спасительница должны объединиться с Ником Фьюри, Соколиным Глазом, Чёрной Вдовой, Чёрной Пантерой и Халком, чтобы уберечь Землю от злого Маклуанского Повелителя!