Астронавт Молли Вудс пытается восстановить связь со своим мужем Джоном и их сыном Этаном после возвращения из 13-месячной одиночной миссии в космосе. Таинственные приключения Молли в космосе вызывают последствия, которые, в конечном счете, изменят ход истории человечества.
После того, как Молли падает в обморок, в котором видит свое столкновение на Серафиме, Сэм соглашается сделать ей ультразвук, чтобы больше узнать о ее таинственной беременности. Молли выслеживает Крайгера и он делится с ней ошеломляющими подробностями его собственной одиночной миссии, которые Международное Агентство по Исследованию Космоса (МАИК) держит в секрете.
После того, как Джон обвинил Молли в том, что она ведет себя отстраненно, ей необходимо решить, будет ли она рассказывать ему о своей беременности. Тем временем, Джон и Молли встречают родителей, которые с подозрением отнеслись к Этану, когда он первый раз пошел в школу.
После того, как Спаркс попытался изолировать Молли, она со своей семьей находит убежище на далеком острове, где обособленно живет ее отец Куинн. Когда агентство окружает их, Этан подвергается серьезной опасности. Тем временем, Ясумото проводит эксперименты со странной и смертельно опасной субстанцией.
Джон начинает сомневаться в психическом состоянии Молли, когда истинность ее беременности встает под вопрос. В это же время состояние Этана сильно ухудшается, а Джон и Джули спорят о том, как нужно его лечить.
Молли находит видеоматериал, который может помочь выявить настоящую причину, по которой МАИК выбрало ее для одиночной миссии. Тем временем, Этан видит свой первый сон – непредвиденное улучшение, к которому он не был готов. Джули отрывается от работы с таинственным человеком, которого она встретила в спортзале.
Молли убеждена, что ее ребенок находится у агентства и хочет найти его. В это время Джон наталкивается новые поразительные открытия в программировании Этана, а Керн пытается заполучить разоблачающее видео, которое было украдено у МАИК.
Когда Молли узнает, что ее ребенок жив, она с Керном и Крайгером разрабатывает план, чтобы перехватить ребенка, пока Спаркс и Ясумото не сменили его местонахождение. Джон всеми силами старается угнаться за быстрым развитием Этана.
Спаркс находится под влиянием видения о его погибшей дочери и сбегает с ребенком Молли. Теперь Ясумото и Молли должны положиться друг на друга, чтобы выследить ребенка.
В то время, как Молли приближается к тому, чтобы найти «отпрыска», Джон понимает, что, возможно, у Ясумото есть свои цели. Спаркс делает все, чтобы поддерживать жизнь ребенка и продолжает видеть свою погибшую дочь.
В то время как силы ребенка растут, Молли узнаёт о болезненном пути Ясумото к бессмертию. Когда Спаркс начинает подвергать сомнению миссию, Аня принимает управление. Между тем Один пытается тайно получить доступ к схеме Итана.
Когда Молли наконец встречается со своим ребенком, она понимает, что может быть единственной способной остановить грядущую опасность. Между тем Джулия раскрывает тяжелые тайны Одина.
Молли возвращается в космос, чтобы перенаправить Серафим прочь от Земли и защитить население мира от смертоносных спор. Кроме того Джон обнаруживает, что из-за плана Одина Итан попал в ужасную опасность.
Астронавт Молли Вудс, лишившись сына и мужа, становится пациентом психиатрической клиники. Даже пройдя курс лечения, она вынуждена оставаться здесь — врачи не верят в ее адекватность. Вудс уверена, что так правительство пытается ее заткнуть. Однако желание расследовать ряд таинственных убийств все-таки выводит ее на свободу — правда, всего на трое суток.
Молли и Рихтер выходят на новую возможную жертву и пытаются спасти ее. Джули пытается наладить отношения с Итаном, но он постоянно вспоминает о матери. Уверенная, что Молли никогда не вернется к Итану, Джули решает ему помочь... В лаборатории тем временем проводят испытание второго, еще не доработанного Гуманика - Люси.
Сын Молли, полупришелец Ахду, ищет встречи с ней. И находит – однако Молли не узнает его сразу. Вычислив место свидания, Тобиас Шеферд организует обстрел, но Ахду исчезает снова. Зная, что он вернется, Тоби настаивает, чтобы Молли убила сына. Тем временем второй Гуманик, Люси, практически готов. Однако этический тест дает странные результаты. Под давлением Анны Джули устраивает демонстрацию нового Гуманика и замечает, что Люси уже выходит из-под контроля.
Случаи беременности от пришельца фиксируются все чаще, и городские клиники принимают меры, чтобы предотвратить эпидемию. Молли Вудс доверяют главное – расшифровать код ДНК спор, привезенных из космоса, и разработать вирус, который спасет человечество от вымирания. Тем временем видения Итана учащаются, и по совету Люси он отправляется на поиски Молли. Чарли обещает Джули, что перепрограммирует Люси и устранит проблемы с подчинением.
Расшифровка Молли кода ДНК инопланетных спор дает первые результаты — разработка спасительного вируса наконец продвигается. В это время Молли, узнав, что Итан был в ее доме, пытается вернуть его под свою опеку, а Рихтер берется выяснить, были ли случайными все последние события ее жизни. Вскоре выясняется, что состояние Молли ухудшается — теперь ее мучают не только видения и приступы.
Молли узнает, что ее ДНК изменилась и она превращается в гибрида. Чтобы обратить этот процесс, она должна создать протокол, который остановит производство инопланетных клеток в организме. Для этого Молли нужно заполучить споры или ДНК Ахду, ее сына-пришельца.
Молли Вудз и Джей Ди Рихтер объявлены в розыск как террористы. Им приходится скрываться вместе с семьей Ахду. Молли не может выбрать, на чьей она стороне — людей или пришельцев. Ее главная задача теперь — предотвратить выпуск собственного вируса, который погубит всех гибридов.
Гуманики нападают на поселение пришельцев и выпускают вирус. Молли пытается спасти умирающего сына, но понимает, что лекарство есть только у Глобал Секьюрити. Идя на риск, чтобы раздобыть его, она пока не знает, повлиял ли вирус на ее здоровье.
Нэйт пытает разработать лекарство от вируса, чтобы спасти Молли Вудз. Однако времени всё меньше — Молли вместе с верой в человечество утратила желание жить. К тому же сильнейшие из выживших гибридов теперь не на ее стороне.
Молли пытается предотвратить взрыв в здании Глобал Секьюрити, и Тобиас Шепард окончательно переходит на ее сторону. Однако Гуманики расстраивают все их планы. Теперь под угрозой не только жизни гибридов, но и всех, кого государство решит назвать предателями.
Молли и Рихтер находят Калдерона, и многое открывается в новом свете. Оказывается, «высшее руководство» является куда более всемогущим, чем все думали. Чтобы справиться с ним, нужно уничтожить проект «Гуманик» в кратчайшие сроки. К этому же выводу приходят Чарли и Джули. Они пытаются приостановить отправку Гумаников в другие страны и выяснить, кто управляет ими на самом деле. Но пока Гуманики действуют на опережение.
У героев шесть часов, чтобы предотвратить гибель человечества. Сделать это можно, отключив Тэйлора, что не так просто. Разработав план действий, Молли Вудз собирает команду, перетягивая на свою сторону даже госсекретаря. Однако в распоряжении Тэйлора куда более подготовленная армия.
После первой неудачной атаки Молли ищет подкрепления среди гибридов. Тэйлор тем временем тоже укрепляет позиции — теперь и в его армии есть Молли Вудз, Гуманик нового поколения. Приближается время нового наступления. Однако Молли колеблется — ведь если отключить Тэйлора, погибнет ее сын Итан.