(эпизод не был выпущен)
Эко — одна из «Кукол» в элитном и незаконном Кукольном доме. С помощью загрузки индивидуальности она становится идеальной девушкой-подарком на день рождения богача, а затем исполняет роль переговорщика для спасения похищенной с целью выкупа девочки. Тем временем, агент ФБР Пол Баллард пытается раскрыть информацию о Кукольном доме, терпя насмешки от коллег по работе.
Эко куплена красивым молодым клиентом по имени Ричард для свидания на природе, но оказывается что Ричард воспринимает её не только как девушку, но и как добычу, на которую собирается поохотиться. Тем временем, агент Баллард получает подсказку о прошлом Эко в виде фотографии, а также мы узнаем о шрамах доктора Сандерс, которые её нанёс, сошедший с ума кукла Альфа.
Эко становится девушкой на подпевках и тайным телохранителем известной певицы, которую несколько раз во время выступлений пытался убить сумасшедший фанат.
Эко становится искусным грабителем, чтобы украсть ценное художественное произведения из хранилища под отелем, но Альфа с помощью телефонного звонка звуковым сигналом стирает эту личность и Эко превращается в беспомощную куклу, закрытую в хранилище с двумя грабителями.
После совершения покупок сектантов продавец магазина обнаруживает на обратной стороне списка покупок просьбу о помощи. Правительственная организация нуждается в помощи Кукольного дома для того, чтобы получить доказательства, позволившие бы арестовать главу этой секты. Решено запрограммировать Эко в слепую фанатичку, которая с легкостью внедряется в секту.
О Кукольном доме снимают репортаж с опросом местных жителей. Выясняется, что довольно много людей верят в него. Тем временем Эко исполняет роль любящей жены миллионера, показывающего ей купленный дом. Агент Баллард во время очередного расследования сталкивается с Эко прямо в этом доме, но её увозит манипулятор Эко. Баллард допрашивает миллионера о том, как так вышло, что он покупает людей…
В лаборатории при университете пропала одна из двух ампул нового экспериментального препарата для улучшения памяти. Выясняется, что препарат передается от принявшего его путём прикосновения. У обычных людей он вызывает на несколько часов симптомы наркотического опьянения, у кукол — восстанавливает стёртые воспоминания.
Внутри кукольного дома назрела критическая ситуация — куклы даже после стирания проявляют инстинктивные потребности к мятежу. Однажды ночью они просыпаются в своих обычных ложах с их истинными личностями, притворяясь куклами, вводят персонал в заблуждение и совершают побег.
Руководство кукольного дома понимает что у них завелся «крот». По ложному следу отправляется кукла Сьерра, а в это время загруженная в Эко личность выявляет настоящего шпиона.
В Эко загружена женщина, которая недавно умерла. Она общается с родными, представившись близкой подругой покойной, в надежде найти своего убийцу. В это время Тофер запрограммировал Сьерру на «своего друга», чтобы весело отметить свой день рождения.
Эко использует историю «Спящей красавицы», чтобы помочь маленькой девочке преодолеть травму прошлого, но история предвещает собственное будущее Эко. В Сьерру загружен судебный патологоанатом для экспертизы тела с характерными ранами, оставляемыми Альфой. Тем временем, Баллард в своем расследовании выходит на след проектировщика некой полностью закрытой экосистемы и, допросив его, выясняет, где находится Кукольный дом. Он заставляет проектировщика провести его внутрь и проигрывает в схватке с Бойдом. Соглашается работать на Кукольный дом в обмен на свободу куклы Ноябрины.
Альфа похищает Эко с загруженной личностью глупой и жестокой девушки. Вместе они похищают другую девушку, в которую Альфа загружает истинную личность Кэролайн. Он загружает несколько десятков личностей в тело Эко, как когда-то загрузили в него, и пытается натравить их на Кэролайн в чужом теле. Баллард с Бойдом едва успевают спасти как куклу так и единственную уцелевшую копию жесткого диска с личностью Кэролайн. Альфа смог уйти.
2019 год. Группа выживших, спасаясь от сошедших с ума по всей планете кукол, находит лазейку в Кукольный дом. С помощью кресла они восстанавливают события, предшествовавшие катастрофе. Затем с помощью найденной личности Кэролайн они начинают свой путь к Убежищу.
Баллард использует Эко для личных целей, внедрив её, как жену торговца оружием Мартина Клара. Шпионы Мартина предоставляют ему в доказательство фотографии, где Эко контактирует с Баллардом, и он понимает, что она не та, за кого себя выдает. Лишь благодаря остаточным навыкам личностей, загруженным Альфа, Эко и Баллард избежали смерти от наемников Мартина. Между тем, Клэр Сандерс не может справиться с тем, что она когда-то была куклой и всячески досаждает Тоферу. Сенатор Даниэль Перрен начинает расследование против корпорации Россум. Баллард соглашается стать манипулятором Эко.
Эко выполняет роль любящей жены и матери, но однажды находит фото настоящей жены клиента. Он отменяет её заказ и говорит, что избавится от ребенка. Эко воспринимает это, как угрозу жизни для себя и её малыша. Она совершает попытку побега, но Баллард находит её. Тем не менее инстинкт материнства пробуждается в Эко даже после стирания.
Психопат Терри оказывается сбит машиной при поисках новой жертвы для своей коллекции. Он находится на лечении в Кукольном доме так как его дядя является акционером. Личность Терри загружается в Виктора для допроса Баллардом. Далее дядя похищает куклу. Виктор-Терри сбегает, убив дядю, и продолжает поиск жертвы. Пока Баллард ищет его, Тофер совершает план Б — дистанционную очистку. Тем временем в Эко была загружена распутная студентка Кики и из-за сбоя её личность меняется местами с Терри.
Нолан Кенард добивался Прии (нынешней Сьерры), но, не добившись, делает её куклой. Тофер по наводке Эко выясняет, что не сделал доброе дело, как он считал — Прия не была сумасшедшей, её такой сделал Нолан своими седативными препаратами. Адель узнаёт об этом и отказывает Нолану в обслуживании, но тот грозится её увольнением и требует Сьерру себе навсегда. Тофер загружает в Сьерру личность Прии, которая убивает Нолана, узнав, как он её использовал. Бойд помогает Тоферу избавиться от тела и замести следы.
Мэделин Костли (бывшая Ноябрина) выступает на пресс-конференции сенатора Дэниела Перрина как свидетель против Кукольного дома. Баллард выясняет, что жена мэра (Синди) — спящая кукла, представляющая угрозу для Мэделин. Решено провести дистанционную очистку с помощью устройства Тофера. В это время Эко делают проституткой, которая собирает компромат на сенатора, переспав с ним, пока он был в отключке. Сенатор везёт её показать жене, как доказательство. Баллард использует устройство и выясняется, что кукла не жена, а сам сенатор. Он вместе с Эко пытается убежать от команды Вашингтонского Кукольного дома, но их ловят.
В Вашингтонский Кукольный дом приезжает Адель и Тофер, чтобы забрать Эко. У местного программиста, Беннетт Хальверсон, на Кэролайн давняя обида за предательство и она пытает её. Беннетт загружает часть своих воспоминаний в Эко и способствует их побегу с Дэниелом. Тофер с Беннетт пытаются отключить их дистанционно, но Беннетт делает из сенатора убийцу для того, чтобы он убил Кэролайн. Охотясь за ней, он убивает охранника и Синди. Его ловят и позже на пресс-конференции он заявляет, что никакого Кукольного дома нет, Эко остается в состоянии куклы на свободе, а Мэделин стирают в Вашингтонском Кукольном доме.
3 месяца Эко скрывается от Кукольного дома с помощью Балларда. В магазине она знакомится с эмигранткой, для которой ворует еду, в результате чего та попадает в тюрьму. Эко сбегает от полиции, но вскоре устраивается на работу в тюрьму медсестрой и пытается вызволить эмигрантку, имитировав её смерть. Но эмигрантка очнулась не вовремя и их обеих запирают в камере. Эко пришлось совладать со своими личностями и научиться вызывать их навыки, когда ей это нужно. Они совершает побег с девушкой. Когда Эко возвращается в Кукольный дом, Адель помещает её в изолятор.
На первом же своём заказе после изолятора Эко получает послание от Альфы в виде мёртвого клиента. Бойд выясняет, что многие заказчики Эко уже убиты Альфой, более того прибывшая с задания Сьерра проболталась о том, что была у Альфы. Баллард навещает Мэта Каргера, который заказывал Эко на каждый свой день рождения, где Альфа взрывает его. Последнего оставшегося в живых заказчика, Майнера, доставляют в Кукольный дом для обеспечения безопасности. Альфа проникает в дом, активизирует кукол против персонала благодаря вирусу, который принесла в кресло от него Сьерра и полностью стирает личность Балларда.
Роджер, личность в Викторе, которую частенько использует Адель в личных целях, отвергает её из-за любви к Сьерре. Контракт Виктора заканчивается и его отпускают, но в первую же ночь его похищают солдаты Россума, обладающих коллективным разумом и Виктор присоединяется к ним. Эко не может допустить этого и с помощью Прии в Сьерре и своих невероятных навыков вызволяет Виктора и нейтрализует армию Россума. Адель, взяв себя в руки, встает на сторону Россума и отправляет всех троих на Чердак.
Путешествуя в своем разуме, находясь на Чердаке, Эко встречается с бывшим главой безопасности. Они выясняют что все разумы связаны между собой, все Чердаки мира тоже. Спасая Виктора и Сьерру от Темного, они попадают в его мир и узнают, что это один из двух основателей корпорации Россум и что миру грозит технологический апокалипсис. Эко намеренно погибает в мире фантазий, чтобы и её тело на чердаке умерло, чтобы попытаться воскреснуть и спасти остальных. Тем временем Тофер загружает в мозг Балларда архитектуру куклы. Выясняется, что Адель была на стороне своей мятежной команды и послала Эко на Чердак за секретными сведениями.
Диск с личностью Кэролайн пропал. Виктор и Баллард выкрадывают Беннетт для восстановления копии диска, уничтоженного в своё время Альфой. Также Баллард выкрал Мелли. Показана история знакомства и «предательства» Кэролайн и Беннетт. В Кукольном доме Лос-Анджелеса куклам возвращают их личности и эвакуируют. Бойд убивает представителей Россума, был ранен и вынужден бежать. Тофер окончательно влюбляется в Беннетт, но её убивает вернувшаяся Сандерс. На Кукольный дом нападают солдаты. Энтони и Прия сбегают.
Команда Кукольного дома прибывает в главный штаб Россума. Энтони и Прия возвращаются в Кукольный дом, где Энтони загружает в себя Тофера 2.0 и обнаруживает, что Бойд — создатель Россума. Тофер в неведении дорабатывает свой «направленный стиратель личности». Бойд активировал спящий режим Мелли и, на секунду опомнившись, она кончает жизнь самоубийством, чтобы не навредить Балларду. Энтони и Прия спасают Эко, которая после многочисленных битв чуть было не проиграла Бойду, но его стирает Тофер. Бойд, обвешавшись взрывчаткой и будучи стертым, взрывает себя у центрального процессора.
Кэролайн в теле маленькой девочки и двое выживших по пути к убежищу пойманы солдатами Россума в Нейрополисе. Среди пленных оказываются Эко и Баллард, которые быстро всех вызволяют, выкрадывают сошедшего с ума Тофера и доставляют всех в убежище. Дождавшись Энтони с его отрядом «перепрошитых», команда направляется в Лос-Анджелесский Кукольный дом, чтобы Тофер мог завершить своё устройство, отменяющее очистку всех кукол планеты. Баллард погибает в перестрелке. Альфа защищал Кукольный дом и стер кукол-мясников, что были в нем. Тофер в офисе Адель вручную активирует своё устройство-бомбу и, погибнув, возвращает всем куклам их истинные личности.