Британский разведчик Том Лоу получает задание от командования охранять уникальный хронометр и его создателя Фредерика Найтингейлаот захвата пиратами, а также, при возможном нападении последних – выследить и уничтожить легендарного Эдварда Тича по прозвищу «Черная Борода», официально объявленного убитым много лет назад. Под личиной корабельного хирурга Лоу отправляется в плаванье на судне под названием «Буревестник», но уже скоро мужчине предстоит встреча лицом к лицу с противником, который, в свою очередь, прикладывает все усилия, чтобы и не дать умереть отравленному Томом изобретателю и расшифровать его дневник.
Заполучив хронометр, Тич приглашает на свой остров капитана Сэма Валентайна, надеясь заручиться его помощью в реализации плана по продаже устройства англичанам, что доказало бы правдивость слухов о кончине легендарного пирата, однако бывший союзник на сей раз не намерен помогать старому другу. Между тем Лоу, делающий все, чтобы быть в курсе намерений Эдварда, внезапно оказывается в самой гуще искусственно созданных и весьма опасных событий, которые едва не приводят к его собственной гибели.
Когда Кейт во время очередного торгового рейса попадает в засаду, Джеймс, зная, что Тичу легче убить женщину, чем освободить ее из лап англичан, просит Лоу спасти супругу, пока Джаггер не добрался до нее первым. Вскоре Том объединяется с Эдвардом, чтобы не только помочь Бальфур выбраться из плена, но и предотвратить рассекречивание местоположения острова. Между тем Чарльз получает задание защитить Селиму, которая смертельно боится покинуть стены собственного дома, а внезапное появление среди жителей пиратского пристанища младенца изменяет настроение многих, включая и Черную бороду, для которого это становится грустным воспоминанием о собственном прошлом.
Селима переживает за то, что Эдвард мог узнать об их с Чарльзом интрижке, в то время как Тич, встревоженный поставленным ему Томом диагнозом, пытается ускорить реализацию своего плана, направленного на захват Ямайки. Сам Лоу, тем временем, берется облегчить боли Джеймса, начав реабилитацию мужчины и поставив точку в отношениях с Кейт, а также решается сообщить Уильяму информацию о замысле Черной Бороды. Финнеган же обращается с предложением о продаже хронометра к Джаггеру, который сразу же вскрывает его обман и принимает ответные меры.
Узнав о пороховых запасах Тича, Лоу решает предупредить об этом Джаггера, для чего под предлогом покупки необходимого для лечения Эдварда инструмента отправляется на Ямайку. Однако, выяснив планы Уильяма по поводу судьбы жителей острова, Том отказывается от первоначальных намерений. Между тем, Селима переживает о том, что Черной бороде известно об ее измене, но, вместе с тем, Эль Ширад поднимает вопрос доверия между ней и Тичем, на что он открывает женщине правду о своем состоянии и делится надеждами насчет ее будущего. Тем временем Нэнна проворачивает важную сделку, Джеймс пытается восстановить отношения с супругой, а Эдварда продолжают преследовать видения.
Притязания Роуз на богатство Нэнны становятся все более настойчивыми, что вынуждает последнюю найти единственно возможный выход из непростой ситуации. Лоу возвращается на остров, где Селима подвергает сомнению его методы лечения, а также его верность Тичу, в то время как сам Том решает раскрыть свое инкогнито Кейт и поделиться с ней тайной о замысле Эдварда, не зная, что их разговор подслушивается. Тайна корабельного хирурга мгновенно становится достоянием общественности, что вынуждает того пленить Черную Бороду, однако высказанное отношение Лоу к жителям острова впоследствии спасает ему жизнь. Тем временем Джаггер находит новый способ пытать свою заключенную, и случайно получает бесценную информацию.
Встревоженная пропажей Роуз, Нелли обращается за помощью в Лоу, который, прочтя предназначенная Тичу письмо, узнает об истинной виновнице исчезновения Драйден. Нэнна, тем временем, начинает тайную войну против Тома, опережая его в умении подтасовывать факты, а также заручаясь поддержкой желающего избавиться от давнего врага Джеймса. Эдвард же, мучаясь от лихорадки, вспоминает события восьмилетней давности, когда его супруга Антуанетта, сойдя с ума, совершила страшное злодеяние, в то время как Лоу в очередной раз избегает смерти для того, чтобы вскоре взять на себя наказание, предназначающееся супругу любимой женщины.
Еще не оправившегося от ран Лоу Тич посвящает в свой новый план – разгромить корабли испанцев, чьи торговые пути благодаря Тому теперь стали ему известны. Параллельно, Черная борода делает Селиме предложение, которое та согласна принять с одном условием. Кейт, тем временем, ищет выход из сложившейся неблаговидной ситуации, однако ее необдуманные действия едва не приводят к гибели, а Чарльз узнает, что на преследуемом ими корабле находится Джаггер, и затевает бунт против Тича, но последний напоминает ему и остальным членам команды, что он не просто так носит пугающее прозвище.
Жители острова не готовы просить Тичу случившееся с Ричардом, однако их планы мести рушатся из-за вторжения на остров англичан во главе с Джаггером, нашедшим надежный источник информации о местоположении Черной Бороды. Объявив войну неприятелю, Эдвард и не подозревает, что у Уильяма припасено секретное оружие, которое способно убить самого дорогого пирату человека. Между тем Чарльз пытается искупить собственную ошибку, а Том узнает об истинном замысле Тича, и решает раз и навсегда избавить ставших ему близкими людей от угрожающей им опасности.