После битвы за Нью-Йорк агент Фил Колсон, чудом спасшийся от смерти, собирает команду агентов для расследования странных происшествий, которыми, впрочем, уже не удивишь широкую публику. Их первым заданием становится найти и обезвредить Майка Питерсона, который демонстрирует сверхспособности после того, как стал подопытным в неком проекте «Многоножка». И в этом им поможет человек, который всеми силами старается разоблачить Щ.И.Т...
В команде Колсона пополнение – хакерша Скай, выступающая в роли временного консультанта. Возможность показать свои таланты не заставляет себя ждать – агентам нужно срочно прибыть в Перу, где был обнаружен «0-8-4», то есть объект неизвестного происхождения. Скоро становится ясно, что этот объект – не что иное как забытая технология Гидры, питающаяся энергией Тессеракта. И пока Колсон решает, как поступить дальше, судьба преподносит ему новый сюрприз в лице старой боевой подруги.
У агентов ЩИТа новое задание – найти доктора Франклина Холла, талантливого ученого и по совместительству бывшего преподавателя Фитц и Симмонс. Похититель – миллионер Иэн Куинн, задавшийся целью запустить генератор, который способен изменить гравитационное поле Земли. Однако чтобы помешать ему, необходимо сначала проникнуть на территорию роскошного особняка Куинна на Мальте, чего ЩИТ сделать не может из-за угрозы международного конфликта. Вот если бы у них был человек, не являющийся официальным агентом... как Скай, например.
Команда Колсона расследует серию краж бриллиантов, совершенную бывшей протеже Колсона Акелой Амадор. Пытаясь найти объяснение такой перемене характера, агенты выясняют, что девушкой управляет неизвестный заказчик, передавая приказы прямо во встроенный кибер-глаз. Который, кстати, легко можно взорвать, если Акеле вдруг вздумается ослушаться приказа. Колсон решает пойти на рискованный шаг, чтобы помочь бывшей коллеге, а заодно выяснить, кто ставит эксперименты на агентах ЩИТа.
Агенты ЩИТа получают задание найти Чан Хо Ина – китайского уличного фокусника, обладающего пиротехническими способностями. К сожалению, их опережает опасная вербовщица проекта «Многоножка» Рэйна, которой Чан нужен для дальнейших экспериментов. Решившись на опрометчивый шаг, Скай ставит под угрозу с трудом заработанное доверие команды и вынуждена открыть Колсону истинную причину своего сотрудничества с «Наступающей волной» и ЩИТом.
Команда пытается найти причину загадочной череды убийств, связанных с левитацией и электростатическими аномалиями. Отказавшись от первоначального предположения о неизвестном типе оружия, агенты обнаруживают, что в действительности виновен инопланетный вирус. Найдя источник заражения, все вздыхают спокойнее, однако ненадолго – ведь один из членов команды успел заразиться. И Колсон готов на все, чтобы его спасти – даже ослушаться прямого приказа начальства.
По прибытии в командный Центр ЩИТа агенты Уорд и Фитц получают от агента Виктории Хэнд задание отправиться в Южную Осетию, чтобы обезвредить опасное оружие. Оставшиеся в Центре Скай и Симмонс так переживают за ребят, что решают взломать файлы 8 уровня секретности, чтобы узнать об операции больше. Тем временем Колсон раскрывает личность человека, сдавшего Скай в приют, однако не торопится рассказать об этом девушке, поручив дальнейшее расследование агенту Мэй. Удивительно скорее то, что ему не удается выяснить некоторые факты своей биографии – например, как ему удалось выжить в битве за Нью-Йорк и при чем здесь Таити.
Команда Колсона пытается помешать группе норвежских язычников собрать все три части асгардийского Посоха берсерка, который наделяет своего владельца огромной силой и неконтролируемой яростью. На помощь агентам приходит доктор Эллиот Рэндольф, подкованный в области скандинавской мифологии не хуже Тора. Во время поисков нескольким членам команды выпадает шанс опробовать внеземную силу на себе – однако это оказывается не так весело, как можно было подумать.
Агенты ЩИТа расследуют странное происшествие с инспектором по технике безопасности Ханной Хатчинс. Они подозревают Ханну в применении телекинеза, сила которого спровоцировала несколько взрывов. Однако когда выясняется, что такими способностями женщина не обладает, задача команды Колсона усложняется. И пока агенты пытаются понять, чем вызваны окружающие Ханну паранормальные явления, у них появляется шанс узнать больше о прошлом Мэй.
Когда из тюрьмы с помощью усовершенствованных суперсолдат «Многоножки» сбегает Эдисон По, команда Колсона просит помощи у бывшего подопытного «Многоножки», а ныне подающего надежды новобранца ЩИТа Майка Питерсона. И когда он уже готов дать отпор врагу, выясняется, что Рэйна взяла в заложники его сына Эйса. Требования просты: «Многоножка» обменяет мальчика на его отца. Однако в последний момент выясняются новые подробности сделки – оказывается, что Рэйне нужен вовсе не Майк...
Пока Эдисон По пытками пытается вызнать у Колсона секрет его воскрешения, агенты ЩИТа под предводительством Виктории Хэнд всеми силами пытаются его найти. Все, кроме Скай, которую Виктория отстранила от дел, так как до сих пор не доверяет хакерше-бунтарке. Однако когда Скай это останавливало? Тем временем Колсон сдается и позволяет Рэйне использовать на нем аппарат, который проведет его вглубь собственных воспоминаний и покажет, что же на самом деле случилось после битвы за Нью-Йорк. Однако не пожалеет ли он об этом?
Уорд, Скай, Фитц и Симмонс отправляются в Академию ЩИТа для расследования случая заморозки одного из кадетов, который буквально вмерз в лед в бассейне. Оказывается, что Фитц и Симмонс – настоящие звезды: почетные выпускники, гениальные ученые, любимцы преподавателей и кадетов. С одним из них, застенчивым гением Донни Гиллом, Фитц даже успевает подружиться, пока команда занята поиском охлаждающего устройства. А тем временем Колсон и Мэй выслеживают бывшего агента, которому что-то известно о прошлом Скай, однако даже они оказываются не готовы к правде.
В погоне за Провидцем команда Колсона инкогнито садится на поезд, в котором сотрудники компании «Кибертек» везут Иэну Куинну особую посылку. Однако прикрытие агентов быстро оказывается сорвано, что вынуждает их применить все свои навыки и таланты для завершения миссии. Единственная загвоздка в том, что делать это приходится в одиночку, да и содержимое посылки оказывается абсолютно неожиданным.
Скай срочно доставляют в больницу ЩИТа, однако даже лучшие врачи могут лишь замедлить процесс умирания. На помощь команде Колсона приходят агенты Джон Гарретт и Антуан Триплетт, которые допрашивают Куинна и выясняют, что тот действовал по приказу Провидца. Очевидно, ранить Скай было необходимо, чтобы выяснить, как Колсону удалось вернуться с того света. В поисках способа спасти Скай агенты отправляются на секретную базу ЩИТа «Гостевой дом», информация о которой строго засекречена даже от агентов 8 уровня. Там Колсон наконец-то выясняет, почему до сих пор жив, однако правда превосходит даже самые дерзкие его предположения.
На Землю прибывает асгардийка Лорелея, обладающая силой подчинять мужчин своей воле, и сразу же проверяет свои чары на простых смертных. И пока она занята попытками собрать личную армию, вслед за ней прибывает леди Сиф, вооруженная личной ненавистью и особым артефактом-ошейником, который подавляет силу чародейки. Команда Колсона вызывается помочь найти и обезвредить асгардийку, однако все идет наперекосяк, когда рабом Лорелеи становится Уорд.
К охоте на Провидца присоединяются агенты Гарретт, Триплетт, Хэнд, Ситвелл и Блейк. Во время поисков главного подозреваемого, Томаса Нэша, Мэй и Блейк сталкиваются с Дэтлоком и успевают посадить на него жучок. И пока агенты Триплетт и Симмонс вместе с Викторией Хэнд следят за операцией из Центра, остальные агенты отправляются за человеком, доставившим им столько хлопот. Однако, как и следовало ожидать, всё оказывается далеко не так просто...
В ЩИТе творится полная неразбериха – ни с того ни с сего команда Колсона и агент Гарретт подвергаются нападению со стороны своих. Пытаясь выяснить, что происходит, Скай обнаруживает во внутренней сети сообщения ЩИТа зашифрованный сигнал Гидры – фашистской организации, борьба с которой во время Второй мировой войны и послужила главной причиной создания ЩИТа. И пока агенты пытаются разобраться, кто свой, а кто чужой, вскрывается и настоящая личность Провидца. И не только его...
События серии разворачиваются параллельно событиям фильма «Первый мститель: Другая война».
Уорд освобождает из тюрьмы Рэйну и представляет ее Провидцу. Девушка крайне разочарована тем, что никакого будущего Провидец не видит, однако все равно соглашается помочь ему воссоздать препарат GH-325. Полковник Гленн Тэлбот отправляет взвод солдат на поимку Колсона и его команды, но тем удается ускользнуть на тайную базу «Провидение», расположенную где-то в канадской глуши. И пока агенты зализывают раны, Уорд и Гарретт запасаются опасными артефактами из самой защищенной тюрьмы ЩИТа – ведь плохим мальчикам нужны игрушки посерьезней.
Дотошный агент Кэйнег заставляет всю команду пройти испытание детектором лжи, чтобы убедиться в их преданности ЩИТу. Как ни странно, проверку удается пройти всем – даже агенту Уорду. А между тем до агентов доходят вести о том, что Холодильник разграблен, и они срочно бросаются ловить сбежавших заключенных, один из которых зациклен на... бывшей девушке Колсона. Которая, кстати, не знает, что тот жив. И кажется, что хуже уже быть не может, когда команду вдруг покидает один из ее членов. Вот только зачем?
Фитц обнаруживает послание, оставленное Скай. И пока команда в ужасе пытается переварить информацию, на базу нападают объединенные силы полковника Тэлбота и, как ни странно, Марии Хилл – правой руки Фьюри. Однако узнав о предательстве Уорда, Мария решает помочь команде Колсона вернуть Скай невредимой. Впрочем, на Колсона надейся, а сам не плошай, и потому Скай решает не сидеть сложа руки, а всеми силами ускорить свое возвращение к друзьям. Она не учла лишь одно звено уравнения – Дэтлока.
Наконец приоткрывается завеса тайны прошлого Уорда, и становится ясна причина его преданности Гарретту. Тем временем Колсон и Мэй проникают на территорию «Кибертека» и выясняют кое-что интересное о Гарретте и его мотивах. Также на сцене вновь появляется наш старый знакомый Иэн Куинн, который, как обычно, задумал что-то недоброе. А Фитц и Симмонс успевают влипнуть в серьезные неприятности...
Презентацию Иэна Куинна весьма бесцеремонно прерывает Гарретт, который, кажется, совсем слетел с катушек. Не обходится и без команды Колсона – она как раз штурмует «Кибертек», причем вполне успешно. И в качестве бонуса один из членов команды получает шанс поквитаться с Уордом – благо, поводов у всех уже накопилось достаточно. Однако настоящий герой всегда появляется в последний момент – не обошлось без него и здесь...
После падения ЩИТа Филу Колсону предстоит непростая задача возродить из пепла организацию, так необходимую человечеству – даже если оно само об этом не подозревает. Однако все прежние агенты ЩИТа разбрелись кто куда – кто-то начал новую жизнь, а кто-то переметнулся в Гидру и пустился во все тяжкие. Преданные люди на вес золота, и Колсон вынужден просить помощи у старых знакомых. А между тем мы узнаем, как в далеком 1945ом агент Пегги Картер вместе с Ревущей командой наведалась на секретную базу Гидры и конфисковала множество инопланетных артефактов, включая загадочный Обелиск. Им, кстати, вдруг заинтересовалось подозрительно много разных людей – включая нашего старого знакомого Карла «Крашера» Крила.
Колсон и его команда продолжают преследовать Крила в надежде перехватить Обелиск раньше, чем его получит Гидра, а Лэнс Хантер обдумывает новое предложение о работе. Фитц пытается справиться со своими проблемами и найти способ победить Крила — а может быть, и нового друга. Тем временем в игру вступает еще одна старая знакомая — и на чьей она стороне, пока непонятно.
Скай продолжает учиться всему, что должен знать настоящий агент ЩИТа, и вскоре ей выпадает возможность проверить вновь приобретенные навыки в деле. Гидра вышла на Донни Гилла из академии ЩИТа с намерением завербовать его — и наши герои должны опередить врага. Фитц пытается помочь друзьям и показать, что он все еще на что-то способен, а Колсон, наконец, открывает агентам истинную причину, по которой из команды ушла Симмонс.
В результате пожара в Майами сгорела церковь. Уцелело только изображение Мадонны с младенцем, на задней стороне которого обнаруживаются странные знаки — такие же, как те, которые в минуты одержимости чертит агент Колсон. ЩИТ отправляется на место, чтобы заполучить картину. Внезапно выясняется, что за ней охотится и генерал Тэлбот. Хотя он как-то странно себя ведет... Фитц никак не может почувствовать себя комфортно в новом коллективе, но чрезвычайная ситуация возвращает ему уверенность в себе.
Скай продолжает исследовать таинственные письмена по заданию агента Колсона. Однако все ее попытки понять причины этого задания не находят поддержки — будто бы Колсон не очень-то и хочет, чтобы Скай достигла результатов. Тем временем Рэйна в отчаянии. Она умоляет отца Скай вернуть ей Обелиск, но тот отказывает, и она решает обратиться за помощью к агенту Колсону. Если он не согласится помочь, Рэйна угрожает раскрыть Джемму. Судя по всему, дни агента Симмонс в логове Гидры сочтены...
Люди в черной униформе нападают на ООН во время заседания и провозглашают: «ЩИТу надоело прятаться». Есть жертвы. Колсон понимает, что Уайтхолл перешел в наступление и теперь хочет убедить весь мир в необходимости окончательного уничтожения ЩИТа. Главным сторонником радикальных мер оказывается один американский сенатор — по знакомой фамилии Уорд.
Агенту Колсону становится все хуже. Загадочные надписи, которые он все время вырезает на стенах, не отпускают его, и он посвящает им все больше времени. В Нью-Йорке найдено тело учительницы рисования из Аойвы, испещренное все теми же загадочными письменами. Колсон узнает эту женщину — она вовсе не учитель, а агент ЩИТа. Может, найдя ее убийцу, он наконец получит ключ к разгадке? В это время вторая половина команды занята поисками Гранта Уорда, чтобы если не поймать его, то хотя бы выяснить — на чьей же он сейчас стороне?
Отец Скай объясняет Уайтхоллу, что Обелиск — не оружие, а ключ. Ключ к тому городу, который обнаружил Колсон. Начинается гонка за обладание тайной, которую скрывает таинственный город, и вопрос в том, кто успеет первым — ЩИТ или Гидра. Счет идет на минуты, а точнее на шесть минут, но у директора Колсона уже есть хитроумный план, который включает в себя радиопередатчик, часы и пуговицу. Тем временем Уорд решает семейные проблемы.
Местонахождение таинственного инопланетного города обнаружено, и Колсон собирается проникнуть в него и уничтожить. Но внезапно Сэм Кейнег, брат Билли (сколько их вообще?), сообщает, что Гидра выследила Рэйну. Команда разделяется — половина отряда летит в Ванкувер спасать Рэйну, а другая — в Пуэрто-Рико разбираться с городом. Тем временем что-то замышляет Уорд, а Бобби пытается помочь Симмонс разобраться с отношениями с Фитцем — хотя ей сперва самой бы разобраться со своими.
Мэй спасает команду от неминуемой гибели, и теперь герои планируют вторую попытку проникнуть в подземный город — и взорвать его к чертям. Но Рэйна, Скай и координаты города теперь у Гидры, так что нужно поспешить. Тем временем в рядах Гидры не все спокойно. Скай наконец-то встречается с отцом — и теперь он, получив от новых союзников все, что хотел, намерен всех их перебить. Уорд, кажется, тоже делает однозначный выбор в пользу Скай, и теперь доктору Уайтхолу нужно бороться не только со ЩИТом, но и со своими недавними соратниками.
Доктор Уайтхолл мертв, а Прорицатель все же был активирован. Рэйна в ужасе пытается избавиться от своего нового облика, а Скай понимает, что Прорицатель как-то повлиял и на нее. Но директор Колсон уверен — сейчас не время обдумывать произошедшее и считать потери: нужно нанести Гидре еще один удар, пока она не оправилась от первого. Сначала он решает заручиться поддержкой генерала Тэлбота и в обмен отдать ему Бакши. Но по дороге Бакши невероятным образом удается сбежать.
В небольшом городке Фару в Португалии полиция находит странную женщину невероятной силы, которая не помнит, где она, и всё твердит про какую-то каву. Директор Колсон срочно вылетает туда и убеждается в своих подозрениях: женщина — леди Сиф из Асгарда. Найденное в интернете видео ее драки с невероятно сильным мужчиной с жезлом не помогает прояснить ситуацию, но осмотр места происшествия наводит агентов на след: противник леди Сиф — из расы крии. И, зачем бы он ни прибыл на Землю, лучше его поскорее остановить.
Узнав правду, Колсон внес Скай в список одаренных и заключил ее под стражу. Друзья хотят ей помочь, и в первую очередь обезопасить ее от самой себя. Специально для Скай ЩИТ вызывает психиатра, который раньше работал с одаренными. Отдельный интерес ситуации придает то, что когда-то этот психиатр был женат на Мэй. Тем временем одержимый идеей мести отец Скай собирает команду особо опасных одаренных и собирается выступить против ЩИТа в открытую.
Уорд, благодарный Агенту 33, которая спасла его во время штурма базы Гидры, ищет способ вылечить ее лицо. Директор Колсон, ради безопасности Скай и всех остальных, отвозит ее в убежище Фьюри, где она должна отдохнуть и попытаться взять свои силы под контроль. А Хантер поближе знакомится с организацией, в которую его притащили Мак с Бобби — и эта организация ему совсем не нравится.
Колсон и Мэй понимают, что Мак и Бобби работают на кого-то еще — и что им нужна шкатулка с инструментами, которую Колсону вручил директор Фьюри со словами о том, что она поможет восстановить ЩИТ. Мы узнаем, как в день, когда ЩИТ пал, был создан другой ЩИТ, и какие цели он преследует. А Скай навещает таинственный гость и приглашает ее присоединиться к новой семье — семье таких же, как она.
Скай обустраивается в новом убежище, знакомится с новыми людьми и узнает много нового об одаренных и их истории в этом мире. Капитан Гонсалес и его сподручные пытаются разгадать загадку шкатулки Фьюри и, кажется, убеждают Симмонс им в этом помочь. Фитц же наотрез отказывается сотрудничать с захватчиками и собирается покинуть ЩИТ. Тем временем Хантер не понимает, как они с Колсоном вдвоем могут победить хорошо организованного и многочисленного противника, но Фил заверяет его, что помощь уже в пути.
Скай учится контролировать свои силы и заодно узнает причину такого специального к себе отношения со стороны хозяев ее нового таинственного дома. Агент Мэй соглашается сотрудничать с новым руководством ЩИТа и узнает, что у Колсона было гораздо больше тайн, чем она полагала. Получив руководство над родным штабом, Мелинда решает полноценно изучить, чем занимался Филипп Колсон на посту директора и что скрывается под кодовым названием «тета-протокол». Просматривая историю Колсона, Мэй вспоминает операцию в Бахрейне, изменившую всю ее жизнь.
Чтобы найти Скай, Колсон хочет внедрить своего человека в Гидру. Ради этого он идет на сделку с Уордом, у которого в багажнике как раз лежит подходящий персонаж — Санил Бакши, который очень рад подчиниться. Под наблюдением Майка Питерсона он выходит на связь с доктором Листом и отлично играет свою роль. Или не играет? Скай проникается теплыми чувствами к отцу и отправляется на прощальную прогулку с ним, чтобы смягчить расставание. Отец хочет показать ей свой офис и родной квартал, но сентиментальная прогулка в любой момент грозит выйти из-под контроля.
Колсон сдался капитану Гонсалесу, предложив ему объединиться против Гидры и нанести удар по их секретной базе в Антарктике, чтобы спасти Линкольна, Майка Питерсона, и, может, даже прикончить всю организацию. Для этого Колсона предлагает направить маленький отряд своих людей, которые смогут незаметно проникнуть на базу, спасти пленников и отключить противовоздушную оборону, освобождая путь остальным. Колсон полагается на Уорда, а тот, в свою очередь, на Санила Бакши, который продолжает работать в стане врага под прикрытием. Скай удается убедить Джай Йин отпустить ее, чтобы спасти Линкольна, и она присоединяется к ЩИТу — старая команда снова в сборе.
Враг разгромлен, и ЩИТ, казалось бы, готов праздновать победу. Рэйна начинает вовсю пользоваться даром провидения и видит угрозу для одаренных, которая скрыта на авианосце Гонсалеса. Вместе с Гордоном она отправляется на корабль, чтобы побольше разузнать о загадочном нечеловеческом узнике за красной дверью. Теперь Гонсалес убежден, что община одаренных несет угрозу, и хочет разобраться с ними раз и навсегда. Колсон предлагает хотя бы попытаться начать с переговоров, а Скай в замешательстве и уже не очень понимает, на какой она стороне.
Переговоры окончились провалом, и агенты ЩИТа возвращаются на базу. Пока члены совета пытаются понять, что произошло, на корабль нападают нелюди. Решивший ненадолго задержаться Мак — последняя надежда агентов. А у Колсона свои заботы: он пытается понять, зачем отец Скай добровольно сдался. Бобби обнаруживает себя в плену у агента Уорда, который помогает Каре расплатиться с Бобби по старым счетам. Скай выбирает сторону нелюдей, но вскоре начинает понимать, что ее матерью двигают весьма сомнительные идеалы.
Скай удается отправить сигнал бедствия Колсону, но Джай Йин это только на руку: она хочет размножить сигнал, отправить его всем агентам ЩИТа и, когда они прилетят, распылить кристаллы, чтобы выжили только нелюди. Теперь Скай, Мак, Колсон и отец Скай, которому последний объяснил ошибочность его взглядов, должны спасти корабль, ЩИТ и все человечество от маниакальных идей Джай Йин. А в это время Мэй и Хантер спешат на выручку Бобби, не имея понятия о том, что их там ждет.
После того как кристаллы Терриген попали в экосистему Земли, планету захлестнула волна необъяснимых смертей и трансформаций. Пытаясь не допустить дальнейшего распространения инопланетного вещества среди простого населения, агенты ЩИТа бросают все силы на поиски вновь обратившихся не-людей. Однако делать это им приходится на опережение — ведь, похоже, не-людьми всерьез заинтересовался кто-то еще.
Лео Фитц убеждает агентов, что камень — это портал, связывающий Землю с другой, очень древней планетой. В поисках человека, который может знать тайну монолита, агенты выходят на профессора Рэндольфа, пришельца, которого камень доставил на нашу планету несколько веков назад. С его помощью они разыскивают машину, открывающую портал, но она ломается при первом же запуске. К счастью, силы Дэйзи могут помочь открыть его снова. Однако что ждет команду Колсона по ту сторону, никому не известно.
Линкольн Кэмпбелл объявлен в национальный розыск как пришелец, и Дэйзи убеждает его примкнуть к команде ЩИТа, где он будет в безопасности. Однако в ходе переговоров с Розалинд Прайс план Колсона с треском проваливается. Тем временем Джемма Симмонс, вернувшаяся на Землю, никак не может привыкнуть к земной жизни — любое явление вызывает у нее приступ паники. Она начинает изучать осколки Камня, однако зачем?..
Монстр продолжает охоту на нелюдей, и выследить его практически невозможно. Сотрудничая с ОБНУ, агенты ЩИТа выясняют, что монстр — их собрат по имени Лэш. Неясно только, как убийство нелюдей могло стать его миссией. В это время Хантеру предстоит внезапная встреча с Уордом, который готов отразить нападение. Под угрозой оказывается жизнь одного из членов команды.
Джемма Симмонс рассказывает о том, что произошло с ней по ту сторону портала. Планета, на которой она оказалась, почти не обитаема, хотя пригодна для жизни. Симмонс — не первая, кто оказался здесь. Много лет назад целый экипаж был отправлен сюда в исследовательскую миссию. В живых остался лишь один человек, и он уверяет, что эта планета — олицетворение зла.
Доктору Гарнеру удалось спастись после взрыва. Мэй возвращается в ЩИТ, привлекает к делу Бобби, и они начинают охоту на Уорда. Тем временем Фил Колсон наконец попадает на своего рода экскурсию в здании ОБНУ. Поиски монстра приводят агентов Скай, Мака и Хантера туда же, и они становятся свидетелями этой экскурсии. Теперь сотрудничество Колсона с Розалинд Прайс кажется им еще более подозрительным. Но главный сюрприз ожидает их на собственной базе.
Узнав, что под личиной монстра-убийцы скрывается Эндрю Гарнер, Мэй решает разобраться с ним самостоятельно. Розалинд Прайс совершает ответный визит на базу ЩИТа, и в конце концов опасность объединяет ее команду с командой Фила Колсона. Эта же опасность откладывает совместный визит Колсона и Розалинд к президенту США, уберегая главу ЩИТа от новых сюрпризов.
Гидеон Малик заманивает Гранта Уорда в ловушку, надеясь навсегда от него избавиться. Но тот оказывается хитрее, и в итоге Гидеон предлагает заключить союз. Он открывает Уорду главную тайну Гидры — историю ее основания и миссию. В этой миссии именно нелюдям отведено центральное место, и теперь среди них — Эндрю Гарнер. В это же время Фитц и Симмонс, пытаясь выяснить детали другой миссии — НАСА, — обнаруживают связь между ней и теми знаками, которые были найдены на стенах замка.
Грант Уорд наконец-то находит способ отомстить Филу Колсону. Одолеваемый чувствами, Фил складывает с себя полномочия директора ЩИТа и готовит новый план борьбы с Гидрой. Однако он не в силах действовать хладнокровно, и, пользуясь этим, Гидра делает следующий ход. Схватив Фитца и Симмонс, Гидеон Малик надеется с их помощью открыть портал. И похоже, что Гранту Уорду в этом безумном предприятии тоже отведена своя роль.
Оказавшись по ту сторону портала, Фитц находит Уилла. Вместе они строят план, как обмануть Уорда и вернуться на Землю вдвоем. Тем временем агенты ЩИТа оккупируют зал в замке, где находится портал, пытаясь не пропустить туда Гидру. В ожидании открытия портала Мак эвакуирует своих людей из замка, опасаясь, что с дальней планеты вернутся не его друзья, а древнее существо, несущее смерть. Правда, как это существо выглядит, никто не знает.
Президент предлагает Филу Колсону продолжать дело ЩИТа и работать с нелюдями под прикрытием ОБНУ. Колсон надеется, что такое сотрудничество сможет вывести его на Гидеона Малика. В это время кто-то совершает нападение на полицейский фургон и крадет оттуда всё оружие. В поисках преступника Мак выходит на Елену, одну из нелюдей. Она и ее брат верят, что смогут сделать мир лучше, лишив его оружия. Однако у них есть серьезный одаренный противник, о котором ЩИТу прежде не было известно...
Гленн Тэлбот назначен главой ОБНУ накануне проведения международной конференции, посвященной инопланетной угрозе — то есть нелюдям. Вместе с Филом Колсоном ему предстоит встретить делегатов и рассказать, кто нелюди на самом деле. А также вычислить информатора, который снабжает Гидеона Малика нужными сведениями. В это время в теле убитого Гранта Уорда крепнет главная сила, которой служит Малик.
Бобби и Хантер приземляются в Сибири, где решается судьба будущего убежища для нелюдей. В лесу их быстро обнаруживают русские, которые не верят Хантеру, уверяющему, что он приехал в отпуск по грибы. Колсон пытается воспользоваться ситуацией и узнать, что планирует Гидеон Малик. Но вместо этого ему приходится думать, как спасти своих агентов от неминуемой гибели...
Здание ОБНУ уничтожено Надзирателями. ЩИТ бросает все силы на то, чтобы разобраться в произошедшем и остановить агрессию. Их цель — Феликс Блейк, в прошлом агент ЩИТа, но его невозможно отследить: он будто повсюду и нигде. Вдобавок ко всему вскоре выясняется, что деятельность Надзирателей — лишь прикрытие для более серьезной миссии...
В городе появляется новый нелюдь – нищий по имени Чарли, способность которого – предсказывать моменты в будущем, связанные с чьей-то смертью. Пытаясь спасти его от Гидры, Дейзи получает от него предсказание, которое пугает всех агентов ЩИТа. В надежде изменить будущее, они готовятся к нему так, чтобы не оставить предсказанию шансов на исполнение. Тем временем Гидра использует способности Чарли в своих целях...
Увидев Уорда, агенты начинают догадываться, что скрывается под его внешностью. Исследуя тела убитых им жертв, Симмонс приходит к неожиданному заключению о том, кем является прибывшее с другой планеты существо. Тем временем сам Гидеон Малик, чье будущее было предсказано погибшим Чарли, старается держаться от Уорда подальше. Однако тот настойчив в своем желании рассказать, кто же он такой.
Дэйзи и Линкольн собирают оставшихся нелюдей, чтобы спасти команду ЩИТа, захваченную людьми Уорда. Им удается освободить свой корабль и взять в плен Гидеона Малика. Всё идет хорошо, пока Колсон и Маккензи не понимают, что один из одаренных в команде ЩИТа теперь на стороне Гидры...
Дейзи теперь в команде Уорда – и не только она. Его армия разрастается. Колсон собирает свою команду, стараясь при этом не привлекать нелюдей, чтобы не подвергать их риску инфицирования. Единственный шанс ЩИТа — найти Холдена Рэдклиффа, ученого из Шотландии, единственного, кто способен вылечить Дейзи и других одаренных. Но самое трудное — не только его найти, но и привлечь на свою сторону...
Уорд берет в свою команду профессора Рэдклиффа, чтобы повторить над человечеством эксперимент, который тысячи лет назад провели над ним Крии. Тем временем команда ЩИТа разделяется. Мэй и Мак вместе с небольшой армией отправляются к Рою, надеясь победить его известным оружием. Симмонс и Фитц остаются на корабле, чтобы найти антидот для борьбы с Уордом. Однако испытать лекарство не на ком, если не считать Линкольна – единственного нелюдя, оставшегося у ЩИТа...
Фил Колсон приглашает генерала Тэлбота на свою базу. Пока тот знакомится с работой ЩИТа, Дейзи выходит на связь с Линкольном и обещает помочь ему сбежать. Сама она сильно ослаблена — ее кровь используется для сотворения новых нелюдей. У ЩИТа всё меньше времени, чтобы спасти Дейзи и убить Улей...
Дейзи спасена, однако планета все еще в опасности. ЩИТ находит базу Улья в Тихом океане, откуда будет произведен запуск боеголовки. Команда ЩИТа разделяется. Тэлбот, Фитц и Колсон получают код для блокировки запуска. Но самое страшное впереди — остальным агентам предстоит встреча с самим Ульем...
Улью удается вырваться и проникнуть на Зефир. Он намерен запустить боеголовку прямо оттуда, и обратный отсчет уже пошел. ЩИТ разгадывает его план и решает направить квинджет с боеголовкой и Ульем в космос. Но с ними должен полететь и кто-то из агентов ЩИТа...
Дейзи становится свидетелем ужасного убийства посреди Лос-Анджелеса. Она пытается выйти на след убийцы, в тот время как ее саму ищет команда ЩИТа. Правда, на этот раз неофициально. У нового директора новые правила, и не все готовы с этим мириться. Но в ходе миссии происходят необъяснимые события, которым никто пока не придает значения...
Люди продолжают видеть призраков, и агенты ЩИТ-а ищут этому рациональное объяснение, в то время как сами призраки готовят к реализации ужасный план отмщения. Однако агенты заняты более важными делами — проведением экскурсии для конгрессменов, ведь новый директор собирается объявить ЩИТ официальной организацией.
За пять часов четыре крупных города в разных странах внезапно лишились электричества, и их число может возрасти. В организации блэкаута обвиняют нелюдей, которые якобы устроили восстание. В ответ люди начинают охоту на одаренных, которые почему-то о восстании слышат впервые... Тем временем Симмонс и доктор Холден пытаются решить другую важную проблему — спасти жизнь Мэй.
Дрожь и Симмонс теперь заодно. Они противостоят Наблюдателям, которые ведут охоту на нелюдей. Кажется, следующая их мишень – старый знакомый ЩИТа Джеймс. Пока Дейзи и Джемма пытаются его спасти, Мак и Колсон совершенно случайно натыкаются на Роба, чья помощь им как раз очень нужна…
Люси Бауэр добирается до своего мужа Джозефа раньше ЩИТ-а. Он погибает, и агенты лишаются главного источника информации об эксперименте, который собирается повторить Люси. Теперь их главная задача — вызволить Илая Морроу раньше, чем Люси проникнет в тюрьму. Для этого они прибегают к помощи Роба, не сообщив ничего об операции директору ЩИТ-а...
Люси Бауэр удалось похитить Илая. Она использует его, чтобы прочитать книгу и воспроизвести эксперимент, который не удался много лет назад. Они отправляются на заброшенную электростанцию, мощности которой как раз хватит для этой цели. Однако запуск может привести к гибели тысяч людей, ведь станция в неисправности.
Робби, Фитц и Колсон оказываются в другом измерении; теперь они невидимы для людей. С помощью Даркхолда это можно исправить, однако книга смертельно опасна для людей... Пока остальные агенты ЩИТа ищут решение, Фитц и Колсон узнают много нового о своем директоре, а Робби успевает лишиться своей важнейшей способности.
Теперь, когда Илай Морроу обрел способность создавать материю, ЩИТу как никогда нужна сплоченная команда. Но что делать, если никто из агентов не доверяет директору? Тем временем деятельность Илая угрожает всему Лос-Анджелесу. В городе замечена повышенная сейсмическая активность, которая может уничтожить всё вокруг. Пока Фитц пытается понять природу сил Илая, Джеффри Мэйс решает использовать любое оружие, каким обладает ЩИТ...
Симмонс удается установить личность нелюдя, которому она помогла пробудиться. Узнав, кто он, директор Мэйс вместе с агентами отправляется на его поиски. Тем временем база ЩИТ-а в опасности. Аида, получив знания от Даркхолда, берет управление станцией в свои руки. Восстание роботов, которого так боялся Мак, вот-вот начнется...
На директора Мэйса совершают покушение. Снайпера быстро ловят, но на допросах он молчит. Следуя протоколу, агенты Колсон и Маккензи эвакуируют Мэйса на квинджете, но тот терпит крушение. Оставшись одни и без связи, агенты надеются, что сверхсила директора спасет их всех от гибели. А вот сам Мэйс надеется на другое...
Агент Мэй пытается бороться с программой, разработанной Холденом. Примерно тем же самым занят и ее близнец-андроид. Тем временем у ЩИТа появляются новые проблемы. Всё начинается с того, что Дейзи в сопровождении других агентов отправляется в Конгресс, чтобы подписать Соглашение Соковии.
Один из агентов Кэйнегов похищен Надир, которая считает, что ему известно, где Даркхолд. Пока его пытают всевозможными способами, другие Кэйнеги объединяются с ЩИТом, чтобы спасти похищенного агента и уничтожить Даркхолд. Никто пока не знает, что среди них предатель в лице Мэй, которая в самый ответственный момент должна выполнить свою миссию.
Агенты Колсон и Маккензи отправляются в Испанию, где живет женщина по имени Агнес, ставшая прототипом андроида профессора Рэдклиффа. Фил пытается убедить ее связаться с Холденом, чтобы помочь им спасти Мэй. Но Агнес непреклонна. Тем временем ЩИТ борется с Терренсом Шокли, который хоть и стал нелюдем, но остался верен Наблюдателям. Он использует свою силу, чтобы заманить агентов в ловушку.
Фитц пытается вычислить местонахождение доктора Рэдклиффа, чтобы спасти агента Мэй и директора Мэйса. Агенты пока не догадываются, что могут угодить в ловушку. Точнее, ловушка предназначена для Фила Колсона в отместку за миссию, в ходе которой когда-то давно Мэй и Фил убили людей из отряда Антона Иванова...
Узнав, что на базе вместо четырех ключевых агентов теперь их двойники-роботы, Фитц и Симмонс пытаются не выдать себя. Тем временем двойники предлагают новый план действий. Они хотят собрать всех Нелюдей на базе и уничтожить их. Холден же пока продолжает совершенствовать и испытывать Фреймворк, пока Аида готовит Антона Иванова к совершенно новой жизни.
Дейзи и Джемма попадают во Фреймворк. Мир, в котором им предстоит найти друзей, совсем не похож на тот, к которому они привыкли. Здесь нет ЩИТа, а Нелюди объявлены врагами. Прежние агенты Колсон, Мэй и Фитц, кажется, забыли о добрых принципах, в которые верили...
Фил Колсон — единственный, кого Дейзи и Джемме удается убедить, что мир, в котором правит Гидра, нереален. Однако происходящее в этом мире может всех погубить. Узнав, что доктор Рэдклифф тоже во Фреймфорке, бывшие агенты ЩИТа начинают его разыскивать. Дейзи отправляется в штаб, а Джемма и Фил Колсон внезапно попадают на подпольную базу Джеффри Мэйса.
Пока Дейзи находится в плену у Гидры, ее друзья из ЩИТа планируют новую миссию. Гидра, в свою очередь, готовится отразить удар и дает распоряжение убить Джеффри Мэйса, известного им как Патриот. Тем временем Джемма Симмонс, чувствуя, что Мэйс и Уорд ей не доверяют, решается рассказать им, что их мир нереален.
Благодаря агенту Мэй Дейзи получила свою силу и во Фреймворке. Вместе они пытаются убить Аиду и бегут из штаба Гидры. Пока агенты ЩИТа пытаются разыскать базу, с которой Аида ими управляет, Леопольд Фитц успевает завершить проект «Зеркало».
У Дэйзи и Симмонс остается всё меньше времени, чтобы вернуться в реальный мир. Квинджет, на котором находятся их тела, почти лишился энергии. Тем временем Аида близка к тому, чтобы обрести реальное тело и снять ограничения программы. Агенты спешат к выходу из Фреймворка, который указал им Рэдклифф, не зная, что Аида опередила их.
Все, кроме Мака, возвращаются в реальность. И в этой реальности Аида — человек, наделенный сразу многими сверхсилами. Она борется за любовь Фитца, в то время как остальная команда ЩИТа вынуждена бороться за выживание.
Елена отправляется во Фреймворк, надеясь вернуть Мака, однако он ее не помнит. Тем временем Аида начинает разрушать Фреймворк, и мир, где правит Гидра, постепенно исчезает. А в реальном мире у Аиды появляется серьезный противник, который вернулся чуть ли не с того света, чтобы ее убить.
В один момент команда наслаждалась пирогом в придорожном кафе, а в следующий внезапно не по своей воле проходит через портал-монолит, забросивший их на борт загадочного космического корабля. Это происходит со всеми, кроме Фитца. Пытаясь понять, где они и зачем туда попали, Фил с остальными вскоре обнаруживают, что главной на громадном сооружении является инопланетная раса, держащая людей в подчинении. Однако главное потрясение ждет друзей впереди — случайный союзник открывает им глаза на происходящее.
Команда знакомится с Тесс, которая нанимает Дика помочь чужеземцам скрыться от надзирателей, замаскировавшись под местное население. Однако затесаться в толпе удается не всем — пытаясь оказать помощь раненному, Джемма попадает в число избранных для служения членам правящей верхушки захватчиков. Колсон с остальными становятся свидетелями процедуры очищения, во время которой им приходится заключить сомнительную сделку с местным дельцом. Между тем Дейзи обнаруживает тайный бизнес Дика и узнает причину уничтожения Земли.
Касиус находит для Джеммы задание — обучить молодую девушку-нелюдя управлять своей силой. Между тем Дейзи с помощью Йо-Йо получает необходимый для проникновения на верхние уровни девайс. Пытающийся образумить женщину Дик предпринимает радикальные меры, чтобы не дать ей совершить задуманное. Колсон тем временем использует экспедицию Тесс по ловле бегунов как прикрытие для проверки записей Вёрджила. Союзникам открывается важная информация, которой так и не успел поделиться погибший повстанец.
Оказавшись в плену у Касиуса, Дейзи знакомится с одним из нелюдей, способных читать мысли окружающих. Позже Скай с Джеммой подвергаются допросу на предмет присутствия поблизости других агентов из прошлого. В процессе женщины получают помощь с неожиданной стороны. Между тем Мак и Йо-Йо по приказу Грилла отправляются выбивать деньги из должника, от которого узнают шокирующие новости о здешних порядках. Эта информация вскоре становится известна и Колсону с Мэй, использующих кстати подвернувшегося Дика для поисков еще одной исчезнувшей подруги.
После внезапного исчезновения товарищей Фитца берут под стражу секретные службы, которые, закрыв мужчину в камере со всем необходимым, пытаются добиться от него информации о местонахождении других агентов. Полгода спустя Лео наконец получает возможность выбраться из заключения с помощью старого друга, вместе с которым мужчина вскоре нападает на след похитителей Джеммы и остальных. Мало-помалу приближаясь к разгадке их пропажи, Фитц вскоре получает возможность отправиться вслед за друзьями в будущее, чтобы исполнить пророчество.
Под видом богатого мародера Лео попадает на прием к Касиусу, где узнает об участи Джеммы, а также становится свидетелем битвы между Мелиндой и Беном. Между тем самого Касиуса ждут неприятные вести об обмане со стороны одного из рабов, а также о внезапном приезде старшего брата, заинтересованного в приобретении «разрушительницы миров» не меньше Фитца. В это же время по приказу начальства начинается внеплановый отбор подростков-нелюдей для терригенезиса, в число которых попадает и хороший знакомый Тэсс. Пытаясь защитить его от незавидной участи, Йо-Йо вытаскивает юношу из-под носа надзирателей, чем подвергает опасности не только его, но и всех оставшихся на свободе агентов.
Фитц, Джемма и Дейзи пытаются скрыться от воинов Касиуса и его брата. А между последними в это время состоится неприятный разговор, вскрывающий старые обиды. Вскоре все агенты встречаются и ставят перед собой новую цель — выбраться из корабля-поселения. Мелинду благодаря помощи незнакомца ждут спасение и неожиданная встреча. Флинт тем временем узнает трагические новости, а также принимает непростое решение и получает поддержку Мака и Йо-Йо. Касиус же, стремительно теряющий авторитет в глазах приближенных, использует ситуацию с беглецами, чтобы найти способ вернуться в семью.
Мелинда, Колсон, Джемма, Фитц и Дейзи знакомятся с оракулом по имени Робин, которая подсказывает агентам способ вернуться в свое время. Тем временем Касиус, отправив Синару в погоню за разрушительницей миров, решает немедленно уничтожить оставшихся под его началом людей. Это только усложняет задачу Мака, Флинта и Йо-Йо, старающихся пробраться на третий уровень в поисках заветной коробки. Между тем Скай на земной базе пытается получить от провидицы ответы, не подозревая, какая угроза поджидает их с друзьями.
Игнорируя советы Энока, команда пытается починить управление самолетом, а Дик никак не решит, на чью сторону встать — пленника или пришельцев из будущего. Тем временем Касиус, узнав, что люди не только выжили, но и захватили несколько этажей, использует секретное оружие, дабы напомнить мятежникам об их положении, а также выдвигает тем условия возможного помилования. Мак, Йо-Йо и Флинт решают пойти на риск, чтобы дать достойный ответ синекожему диктатору. Скай же придется закончить бой, начатый еще на базе.
Благодаря наводке своей провидицы Касиус начинает лично преследовать агентов. После гибели Синары он решается на самые отчаянные меры для достижения желаемого. Тем временем главной задачей членов команды становится помощь Флинту в воссоздании временного портала, а также обеспечение достаточной мощности для его функционирования. В процессе выполнения задуманного Йо-Йо ждет пугающая встреча и зловещее предсказание, Мака — запоминающийся бой, а Дика — нелегкий выбор ради спасения товарищей. Колсон же идет наперекор Дейзи, а возвращение некоторых его коллег ставится под вопрос.
Агенты переносятся в свое время и сразу же берутся выяснять происхождение странного луча света, направленного на Землю из космоса. Пока Колсон с командой пытается исследовать необычное явление, оставшаяся на маяке Скай отправляется на помощь новому знакомому, каким-то образом оказавшемуся в их времени. Остальных членов команды ждет неожиданная встреча с бывшей помощницей, любопытное открытие, а также серьезный бой, не прошедший для друзей без последствий.
Проведя сканирование помещения, Фитц обнаруживает, что взрыв образовал пространственно-временную дыру, которая начала генерировать страхи каждого из членов команды, воплощая их в реальность. Споря о том, кто из них готов пожертвовать собой, чтобы уничтожить пространственно-временную прореху, друзья случайно узнают о секрете Колсона. Тем временем Йо-Йо и остальных начинают одолевать ожившие кошмары, а Дик отправляется на поверхность с важной миссией, от которой зависит исход операции и будущее его новых знакомых.
Фитц обнаруживает, что их старания по запечатыванию разрыва принесли лишь временный результат. Чтобы укрепить «заплатку», агентам нужно найти максимальное количество вещества, способного раз и навсегда закрыть эту щель. Оставшись вместе с Йо-Йо и Диком в убежище, Лео пытается освободиться от приставучего новичка. Остальные же отправляются на поиски человека, знающего о местоположении нужного им вещества. Между тем Вернер фон Штрукер получает от генерала Хэйл предложение присоединиться к ее отряду, а ее дочь Руби делает все, чтобы юноша согласился остаться.
Фитц никак не может придумать способ навсегда закрыть разлом, а тем временем наружу выбирается еще одна аномалия, поразительно похожая на него. Двойник без промедления начинает заниматься своим любимым делом, предварительно взяв одного из членов команды в заложники для своих экспериментов. Между тем Колсону и Мэй удается заманить генерала Хэйл в ловушку, однако чрезмерная вера главы «Щ.И.Т.а» в свое везение играет с ним злую шутку. Симмонс же ждут любопытные новости от Дика, немного скрасившие осознание того, что ее брак оказался под угрозой.
28 лет назад юная Хэйл, уверенная, что ее блестящие знания и умения будут оценены по достоинству, ждет распределения, но оно не оправдывает ее ожиданий. За два года до настоящих событий мать Руби узнает о секретном проекте, связывающем Землю с разумными существами с других планет, призванными помочь в защите от надвигающейся войны. В настоящем же, узнав от генерала про ее проект, Колсон раскрывает причину будущего разрушения Земли, в то время как Дейзи пытается отыскать альтернативное решение текущей проблемы.
Заняв место лидера, Дейзи разрабатывает план спасения Колсона. Джемма заручается помощью восстановившейся Йо-Йо, чтобы вытащить Лео из камеры и найти Фила. Тем временем Хэйл испытывает вещество на Криле. Одержимый голосами, тот отправляется поквитаться с новым заключенным, однако в процессе изменяет свои намерения. Захватив с собой Тэлбота, мужчины стараются выбраться из заключения. Вернер продолжает трудиться над расшифровкой записей отца, а Руби стремится доказать готовность стать разрушительницей миров.
Дейзи спасает Колсон и Тэлбота от преследования Руби, но Дик подстрелен. Его жизнь спасают Мак и Пайпер. Мэй высказывает недовольство к безрассудным поступкам Колсона и говорит, что любит его. В Англии, Фитц, Симмонс и Йо-Йо находят Инфузионную камеру Уайтхолла, охранемую Антоном Ивановым, которого убивает Йо-Йо. Руби, заперевшая Хейл в своей комнате, и Вернер находят Фитца и Симмонс, заставив Фитца согласиться починить камеру взамен на жизнь Джеммы. Тэлбот звонит жене, которая под дулом пистолета Кэндис Ли, помощницы Хейл, произносит Гленну код подчинения Сунила Бакши.
Команде главных героев необходимо срочно отыскать Руби. Они должны предотвратить цепную реакцию, которая в итоге приведет к разрушению Земли. Вот только найти Руби и внушить ей необходимость конкретных действий, оказывается не так уж и просто.
Вся команда оказывается на маяке. Здесь им приходится держать оборону и бороться с превозмогающими силами противника. Это противостояние оборачивается для главных героев неожиданными и серьезными жертвами.
Тэлбот берет Коулсона с собой на встречу с влиятельным врагом. От результатов этих переговоров будет зависеть будущее всей планеты, ведь Земля находится под угрозой тотального разрушения.
Будущее Дейзи в качестве разрушителя миров может претерпеть коренные изменения.
Команда сталкивается перед непростым выбором. Неправильное решение может привести к разрушению Земли. Колсон оказывается между жизнью и смертью.
Команда разделена миллионами световых лет ради решения двух основных задач: найти в космосе погруженного в анабиоз Фитца и понять, кто прорывается на Землю из другой реальности через таинственные порталы. Мак осваивается в новой роли директора, в то время как Йо-Йо решает не ставить крест на своей личной жизни.
Странные пришельцы приступают к осуществлению своей миссии на Земле, для чего им понадобятся таинственные кристаллы. Агенты Щ.И.Т. выслеживают преступников, и Мэй сталкивается с незнакомыми технологиями прежде чем вступить в рукопашную схватку.
Едва разминувшиеся в космосе Фитц и Симмонс наконец-то оказываются на одной планете, но им предстоит пройти длинный путь, прежде чем найти друг друга. Энок применяет свои невероятные способности, чтобы вытащит друга из сложной ситуации. Команде придется столкнуться с новым противником.
Наконец-то в историю возвращается Дик Шоу, живущий полной жизнью и развивающий стартапы. Однако беззаботному процветанию приходит конец, и гостю из будущего грозит смертельная опасность. В это время на базе Щ.И.Т.а происходят странные и ужасные события, которые помогают лучше понять мотивы отряда пришельцев из другой реальности.
У Мэй наконец-то появляется возможность поближе узнать новых врагов Щ.И.Т.а. В это время Скай, Симмонс и другие члены космической команды пытаются спасти Фитца и Энока от хроникомов. Мак, Йо-Йо и доктор Бэнсон продолжают расследование трагедии, произошедшей на Маяке.
Фитц и Симмонс наконец-то вместе, но не свободны. Хроникомы пытаются выяснить у пары гениев способ путешествия во времени. Попутно мужу и жене придется столкнуться с глубокими личными проблемами, которые могут помешать работе и обоюдному счастью.
Мэй удается захватить и привезти на Маяк Саржа и остатки его команды. Агентам Щ.И.Т.а предстоит разобраться с истинной миссией и намерениями пришельцев. В это время Энок, Фитц и Симмонс снова рискуют жизнью, но неожиданно приобретают покровителя.
Команда отважных защитников Земли готова прибегнуть к помощи самых сомнительных людей, чтобы защитить планету от монстра, уничтожающего целые миры. В это время в глубоком космосе на корабле, с которым Фитц и Симмонс возвращаются домой, происходит нечто странное.
Напряжение нарастает, когда к точке встрече на полном ходу приближаются заминированный грузовик Саржа, космический корабль с новой знакомой Фитца и Симмонс и «Зефир» с остальной командой на борту. Удастся ли агентам предотвратить катастрофу? Смогут ли Джемма и Леопольд вернуться на Землю?
На утро после празднования победы не всем удается восстановить в памяти прошлый вечер. Враг, о котором чуть не забыли, снова дает о себе знать. Дик и Фитц пытаются найти связь между Колсоном и Саржем, а остальная команда вычисляет опасного гостя на Маяке. Смогут ли агенты отличить своего от чужого?
Йо-Йо и Мак оказываются в плену у Айзел, но злодейке нужны не эти двое. В это время на Маяке Мэй и Дейзи допрашивают Саржа, пытаясь добраться до его сущности, а Дик, Джемма и Лео изучают способности врага, чтобы найти способ защитить агентов от привычки Айзел занимать чужие тела.
Йо-Йо и Мак встречают старого знакомого, который обладает необычайными способностями. Айзел все ближе к исполнению своего плана, и агентам Щ.И.Т.а придется очень постараться, чтобы ей противостоять. Пока Фитц-Симмонс и Дик разрабатывают средства защиты, Дейзи и Мэй помогают Саржу подобраться поближе к врагу.
Мелинда прикладывает все свои силы для борьбы с Изель, Дейзи и Мак сражаются с Саржем, а Йо-Йо пытается решить проблему своим методом - изнутри. Фитц-Симмонсу приходится же в свою очередь иметь дело с обстоятельствами совсем иного рода - где им придется изменить естественный ход своей жизни, в то время как истинные люди Саржа готовятся к вторжению на Землю.С быстро утекающим из их рук временем команде придется отправиться в ад и вернуться обратно, чтобы остановить конец всего. Но кто из них выживет?
После победы над Айзель и Сержантом команда спасается от хроникомов, переместившись в 1931 год по наводке Фитца, местонахождение которого неизвестно даже Джемме. Она представляет Маку и Дейзи ЖСМ версию Фила Колсона, улучшенную технологиями хроникомов и осведомлённую о всех событиях, произошедших после кончины оригинала. Он должен помочь команде помешать хроникомам под управлением Люка, уничтожить Щ.И.Т. в корне. Йо-Йо получает новые руки. Пока Дейзи и Дик расследуют место преступления, где были найдены безликие тела, оставленные хроникомами, Мак и Колсон направляются в бар Эрнеста Кёнига, предка агентов-близнецов. Кёниг организовывает собрание Франклина Рузвельта, которого Дейзи и Колсон принимают за цель противника, в то время как, на самом деле, ей является Фредди Малик, будущий отец Гидеона Малика, одного из лидеров Гидры. Мак и Дик спасают Фредди, которому передана некая ампула, пока Колсон понимает, что им нужно спасти Гидру...
На Зефире-1 Инок пытается утихомирить Мелинду Мэй, которая потеряла способность испытывать любые чувства. Джемма понимает, что Виола, агент Гидры, передала Фредди компонент будущей сыворотки суперсолдата, с помощью который Иоганн Шмидт станет Красным черепом. Йо-Йо понимает, что не может использовать сверхспособности из-за вмешательства сорокопута в её организм. Команде удаётся спасти Фредди от Люка. Зефир автоматически перемещается в другой временной промежуток, однако Инок не успевает прибыть вовремя. Мэй соглашается пройти осмотр. Кёниг нанимает Инока барменом и просит рассказать ему о Щ.И.Т.е.
Оказавшись в 1955 году близ Зоны 51, которая является базой Щ.И.Т.а, без Инока, команда пытается помешать хроникомам, которые хотят использовать Проект Гелиус, чтобы уничтожить научный трест организации. ЖСМ Колсона и Джемма проникают на базу под видом Джерарда Шарпа и Пегги Картер, однако их рассекречивает агент Дэниел Суза. Мэй и Йо-Йо ищут хроникома, который должен зарядить Гелиус энергией, и предотвращают уничтожение базы, активировав электромагнитный импульс, что отключает Колсона. Его захватывает Суза. После допроса Шарпа Дик и Мак притворяются пришельцами и запугивают Шарпа, чтобы он не нарушил линию времени.
Колсон просыпается в заключении Сузы с системным сбоем, который заставляет его видеть черно-белое изображение и слышать внутренний монолог (в стиле фильма нуар). Он понимает, что текущая дата - это день, когда умирает Суза, доставляя устройство Говарду Старку. Колсон вызывает Зефир с помощью Инока который до сих пор находится в баре. Йо-йо Родригес и Дик находят устройство, но Дика захватывает Гидра. Устройство доставляют к постаревшему Уилфреду Малику, который сохраняет жизнь Дику за то, что Дик пощадил его в 1931 году. Йо-йо и Симмонс обнаруживают, что Мэй испытывает эмоции людей, до которых она дотрагивается. Мак, Колсон и Дейзи понимают, что Суза будет убит Гидрой для того, чтобы он не мог разоблачить их присутствие в Щ.И.Т. Они решают изменить историю и спасти Сузу; после того, как он доставляет устройство, Колсон вырубает Сузу и подделывает его смерть. Суза просыпается на Зефире, а Колсон (уже с исправленным глюком) объясняет их ситуацию. Они снова перемещаются вперёд во времени. Люк, высокопоставленный охотник за хрониками, остается в 1955 году и предлагает помочь Малику.
В 1973 году агенты снова начинают действовать скрытно и обнаруживают, что Щ.И.Т. готовит проект Озарение, который не должен разрабатываться еще несколько десятилетий. Проект разрабатывают во главе с Уилфредом Маликом, который должен был умереть в 1970 году. Уилфред и Хроникомы пытаются захватить агентов, но Дейзи захватывает сына Уилфреда - Натаниэля (который также должен быть мертвым) в заложники, чтобы команда могла сбежать. Натаниэль видит, как Дейзи использует свои силы. Агенты воссоединяются с Иноком и возвращаются на Зефир. Без предупреждения Хроникомы перемещаются к 1976 год, в тот момент когда планируется запуск проекта Озарение, и за ними следует Зефир. Колсон и Мэй устанавливают взрывчатку на Маяке, где запускается Озарение, в то время как Дик и Йо-Йо противостоят Уилфреду, которого впоследствии убивает Дик. Натаниэль захватывает Дэйзи и Сузу с помощью оружия Хроникомов. Мак останавливает детонацию, когда видит, что его родители находятся в плену, что позволяет запустить Озарение. Они используют Зефир, чтобы уничтожить Озарение, выдавая своё местоположение. Натаниэль пытается позвонить Дэниелу Уайтхоллу, чтобы попытаться передать силы Дейзи себе.
Натаниэль хирургическим путём приобретает сверхспособности Дейзи, однако ломает свои кости и умирает. Уничтожив «Озарение», Мак выдает местоположение Зефира-1, и ракеты Маяка повреждают джампер, который позже чинят Джемма и Дик. Дик же узнает, что Инок вживил Джемме имплант, не позволяющий ей знать, где находится Фитц. Колсон и Мэй спасают Стоунера, который убивает Люка. Колсон жертвует собой, уничтожая Охотников, после чего Мэй понимает, что родителей Мака подменили и убили, и Мэй, Мак и Йо-Йо сбрасывают хроникомов с квинджета. Суза и Дейзи возвращаются на Зефир-1. Мак, покинувший Зефир, чтобы побыть одному, и Дик, желавший подбодрить его, застревают в 1982 году, когда Зефир совершает внеплановый прыжок.
Застряв в 1982 году, подавленный Мак проводит следующий год один, впав в депрессию. Дик время от времени навещает Мака и убеждает его прийти посмотреть на новую музыкальную группу Дика, Команда Дика, исполняющая классику 80-х, которая ещё не написана. Дик рассказывает, что он тайно обучал участников группы быть агентами «Щ.И.Т.», и что сознание Колсона было сохранено на жёстком диске. Тем временем сознание Сивиллы также выжило, и она использует одинокого программиста, чтобы построить грубое тело для себя. Затем она создает новых «охотников»-роботов, которые убивают программиста перед вторжением на Маяк в поисках потока времени, который Сивилла использует для предсказания будущего. Мак помогает Дику и новым агентам победить охотников, но маленький робот убегает с потоком времени. Зефир вновь появляется на довольно долгий период, поэтому Мэй и Йо-Йо успевают воссоединиться с Маком и Диком; последний рассказывает о событиях прошлого года и мая. Маленький робот доставляет поток времени выжившему Натаниэлю Малику, который работает с сознанием Сивиллы.
После спасения Мака и Дика, Симмонс сообщает команде, что временной привод продолжает отправлять их в будущее снова и снова, сокращая при этом время до следующего прыжка, пока в конечном итоге время не обрушится на них. Команда нуждается в неактивных способностях Йо-Йо, чтобы деактивировать привод, поэтому Дейзи предлагает проникнуть в Загробье, чтобы получить помощь от Дзяйин. Йо-Йо и Мэй прибывают туда и обнаруживают, что Дзяйин пытается помочь подавленной девушке-нелюдю по имени Кора, которая обладает взрывными способностями. Изучив Йо-йо, Дзяйин приходит к выводу, что проблемы Йо-йо являются скорее психическими, чем физическими, и Мэй использует свои способности эмпата на ней. Йо-Йо рассказывает, что она была свидетелем смерти своего дяди и обвиняла себя в этом. Натаниэль прибывает, с силами Дейзи, и завербовывает Кору, чтобы захватить Загробье. Йо-Йо и Мэй вынуждены бежать, и, вернувшись к Зефиру, Йо-Йо понимает, что она сама сдерживала свои силы, и успешно деактивирует временной привод. Когда экипаж успокаивается, привод времени внезапно снова включается. Инок заявляет, что план не сработал, поскольку Зефир неожиданно прыгает снова.
Зефир попадает в ловушку во временном вихре, а Дейзи в это время просыпается в своей криокамере. После того, как произошло несколько событий, всё внезапно начинает повторяться, и она понимает, что попала в петлю времени, а Зефир становится ближе к центру вихря с каждым проходящим циклом. Она узнаёт, что Колсон также знает об этом и дольше был в курсе, так как Дейзи забывает обо всём, когда умирает. Дейзи и Колсон узнают об имплантате памяти Симмонс, но когда они пытаются удалить его, несчастный случай убивает её. Выясняется, что несчастные случаи были спланированы, и Колсон приходит к выводу, что Инок, который был запрограммирован для защиты имплантата Симмонс, невольно убивал их. После нескольких неудачных попыток им удаётся окончательно удалить имплантат, и Симмонс сообщает им, что силовой механизм Инока может зафиксировать время, но только ценой его жизни. В последнем цикле Инок не раздумывая извлекает из себя этот механизм и умирает, сообщив перед этим Дейзи, что это будет последняя миссия для команды. Вернувшись в Загробье, Натаниэль обучает Кору контролировать свои силы.
Натаниэль вербует молодого Джона Гарретта, показывая его будущее, а также совершенствует способ передачи сил нелюдей своим людям. Щ.И.Т. решает оставить Дзяйин вместе с остальными агентами на Маяке для её защиты вопреки желанию Дейзи, которая серьёзно обеспокоена, узнав, что Кора — её сводная сестра. Колсон и Гордон телепортируются в Загробье, но их захватывают, передают силы Гордона Гарретту, после чего Гордон умирает от истощения. Колсона вместе с остальными захваченными нелюдьми спасают Йо-Йо и Мак, после чего Колсон захватывает Кору. Натаниэль и Гарретт телепортируются на Маяк, последний сражается с Мэй, в то время, как Натаниэль нападает на Дейзи и Дзяйин. Он раскрывает их родственную связь и рассказывает Дзяйин о том, что она в конечном итоге предаст свою дочь. Натаниэль убивает Дзяйин, но убегает после того, как прибывшая Мэй стреляет ему в плечо. Гарретт похищает Симмонс и, воссоединившись с Натаниэлем, угоняет Зефир, в то время, как Дик по незнанию всё ещё находится на его борту. Натаниэль раскрывает Джемме свой план, который заключается в том, чтобы Симмонс рассказала им где Фитц.
Кора утверждает, что она хочет работать на Щ.И.Т., несмотря на то, что агенты предполагают, что у неё есть скрытые мотивы. Понимая, что Сивилла знает о каждом их движении, Дейзи, Суза и Мак решают действовать вопреки своим суждениям и запускают квинджет в космос, чтобы последовать за Натаниэлем. Натаниэль пытается узнать нужную ему информацию от Симмонс, пытая Дика, но у него не получается выяснить, где находится Фитц. Его действия заставляют Симмонс полностью забыть Фитца. Мэй допрашивает Кору, которая в гневе выключает электричество на Маяке, позволяя Сивилле взломать центральный процессор Маяка. Колсон понимает, что может прочитать код, и пытается изгнать её из системы. Кора предлагает использовать свои знания, чтобы преследовать тех, кто заслуживает смерти, таких как Грант Уорд, но Мэй показывает ей труп Дзяйин, из-за чего Кора в гневе набрасывается на Мэй, но Гарретт забирает её обратно на Зефир. Дейзи, Суза и Мак обнаруживают, что Натаниэль связался с остальными хроникомами, которые, используя информацию, украденную Сивиллой, стреляют по всем базам Щ.И.Т.а., уничтожая всю организацию.
Приземлившись на корабль хроникомов, Дейзи ищет Дика и Симмонс, в то время как Суза и Мак отбиваются от группы хроникомов-охотников. Сивилла позволяет Дейзи найти Симмонс, чтобы пробудить её воспоминания, но Натаниэль, не желая больше ждать, убеждает Кору напасть на Дейзи. Дейзи удаётся переубедить сестру, что вынуждает Натаниэля захватить Кору и передать её силы себе. Агенты возвращаются на Зефир и сбегают с корабля хроникомов. Теперь Маяк — единственная сохранившаяся база «Щ.И.Т.а», поэтому Гарретт закладывает бомбы, чтобы уничтожить её, но Колсон, Йо-Йо и Мэй захватывают его и подавляют его силы. Агенты заставляют Гарретта остановить взрыв, но Натаниэль не соглашается и оставляет Гарретта умирать, однако им всем удаётся выжить благодаря Йо-Йо. Гарретт решает присоединиться к агентам и телепортировать их в бар, но его убивают другие агенты, которые прибыли туда, чтобы спрятаться. Все агенты «Щ.И.Т.» объединяются и, с помощью Симмонс, создают «ключ», принцип действия которого изо всех сил пытается вспомнить Джемма. Ключ открывает портал, который приводит к ним Фитца, но он шокирован, узнав, что Джемма не помнит его.
После победы над Айзель, Инок забрал Фитца и Симмонс, чтобы помочь им построить машину времени. Понимая, что они справятся с этой задачей, они решают пожить вместе. После того, как они подготовили всё необходимое, они возвращаются к Флинту и Пайпер и поручают им охранять Фитца в специальном контейнере, пока Симмонс уходит с командой. В баре агенты используют временной привод, чтобы перенести хроникомов в свою временную шкалу через квантовый мир. Дик добровольно остаётся в другой временной линии, чтобы помочь остальным, став новым лидером «Щ.И.Т.а» в этой шкале времени. По возвращении Фитц, Симмонс, Суза и Йо-Йо отправляются на Маяк, в то время как Колсон, Мэй, Мак и Дейзи проникают на корабль хроникомов, чтобы спасти Кору и противостоять Натаниэлю. Колсон обманом заставляет Сивиллу послать всех её хроникомов на Маяк, в то время как Мэй и Кора объединяют свои способности, чтобы дать им сочувствие, после чего хроникомы прекращают нападение. Дейзи уничтожает корабли хроникомов, убивая Натаниэля и Сивиллу. Агенты спасают Дейзи, и Кора оживляет её. Фитц и Симмонс возвращаются к контейнеру со своей дочерью Алией. Год спустя команда собирается вспомнить о времени, проведённом вместе. Фитц и Симмонс уходят на пенсию, чтобы вырастить Алию, а Мэй работает преподавателем в Академии Колсона. Мак продолжает руководить «Щ.И.Т.ом», а Йо-Йо — одна из его главных агентов. Дейзи исследует космос с Сузой и Корой, в то время как Колсон путешествует по миру.